驚雷一聲震巴中，
孤軍八百入川東。
他年列名麟閣上，
平定蜀郡第一功。
聽聞陳邦彥平定了偽楚王之亂，朱亨嘉大喜，遂賜此詩以勉之。
陳邦彥平定了瀘州、重慶、順慶、夔州後，覺得夔州地形險要，土匪眾多，不派大將駐守、易再生變亂。遂令標營副將陳豹領兵一萬五千，分守奉節、雲陽、萬縣。
新歸順的副將賀珍，雖然以前曾是明將，但其在漢中反清時，居然敢自稱奉天倡義大將軍，這可是李自成用過的頭銜！陳邦彥懷疑此人有野心，放在夔州，不放心。遂將他調到順慶府，駐於南充。
順慶府緊挨著清軍占據的保寧，賀珍部又善戰，放在第一線抵禦清軍正好。若其有反意，擺在第一線比擺在後方威脅小。為了怕賀珍不滿，陳邦彥又升賀珍為南充總兵，將白蛟龍部三千人，撥與他指揮。
重慶府則交給降將李占春、於大海駐守，任二人為副將，分駐重慶、壽縣、涪州。為防降將反複，陳邦彥令標營參將嚴思忠領兵一萬，駐守重慶府忠州、澧都一帶，依靠石砫馬氏，扼住東川咽喉。
至於瀘州府，在消滅了馬應試後，已有四川總督樊一蘅的心腹愛將彭明揚領兵七千駐守。對彭明揚，陳邦彥是放心的，任其為瀘州總兵，又再撥給他降兵三千，囑其在瀘州屯糧練兵。
陳邦彥又上奏朱亨嘉，在瀘州、重慶、順慶、夔州等地，各設知府、同知、推官、提學、知縣、通判、典史等官吏。並嚴令各將，從今往後，軍餉一律由朝廷供給，各將領隻管軍事，不得幹預地方政事，更不得私征賦稅，厚斂於民。違者重罰。
自從殺了瀘州馬應試，討平了偽楚王朱容藩後，陳巡撫威名在外，諸將不敢不從。敘州、瀘州、重慶、順慶、夔州，藩鎮割據的現象，**然無存。