清軍攻入青州後，旋即發動了慘絕人寰的屠殺。
青州知府何永清，府城曲允斌逃亡後，城中的百姓有很多也跟著逃奔進了附近的山中，青州城中隻剩三萬餘故土難離的百姓。
但是殺紅了眼的滿洲兵沒有放過城內的剩餘的百姓。
滿洲兵的屠殺整整持續了兩天，三萬餘青州百姓，隻有二十七人躲在地窖和枯井中僥幸活了下來。
崇禎十二年正月二十二日，虜薄青州，臣父挺身抗罵，百折不回，以致箭刃相加，遍身碎臠，迄虜退獲屍之日，其咬牙怒目，罵賊之狀，猶存，比時臣之祖母，臣之叔祖，臣之兄姊婢奴共計四十六名口，俱死於烽焰之中，焦頭爛額，斷手剮心，慘難盡述，臣幸被擄逃回，臣母胡氏跳入井中，屍盈水涸，二命苟存。
奴焚殺異甚，慘毒未有…當是時，合城生靈不啻鼎沸，有挺刃相接，而碎首莫保；有齧血罵賊而延頸受戮；有誌在潔身，而沉淵若歸；有自分一死，而立燼不避；甚至一家之父子兄弟，剪滅無餘；一室之妻妾兒女，殺擄並盡；屍塞於衢巷，血灑夫原隰。焚掠三日，始分營西南，屋宇丘墟，貲畜**掃……有名籍可查者被殺則二萬五千二百餘軀，被虜則四千八百餘名，其他有覆其宗，星其家，及羈客死委巷俘虜而莫之知者，又不知若幹矣。
原任山東督糧道鄧謙南、鄧天申奏報東虜屠殺後，濟南諸縣和青州諸縣的慘狀，當真是慘絕人寰，屍山血海。
青州緊臨黃縣，嶽托部洗劫了青州後繼續東進，於一月底殺入了萊州的濰坊縣。
隻不過濰坊因孔有德之亂後，根本沒有恢複元氣，靖北軍又盡遣黃縣、濰坊之民轉入萊州，東虜是一無所獲。
對於這樣的結果，顯然不能讓大清的成親王和他所部的滿蒙大軍滿足，殺紅了眼的八旗兵迅速東進，直逼萊州門戶黃縣。