14時25分，“揚武”號以主炮命中“杜居士路因”號的艦橋，重達150磅的炮彈把單薄的艦橋徹底摧毀，艦長及所有艦橋人員7死17傷。
“揚武”號上響起一片歡呼聲——明軍眼看敵艦艦橋消失在火海中，誤以為已經幹掉法軍指揮係統了。
法國人始終沒有掛將旗，這讓明軍上下大部分人都產生了誤判。
但是隨後，“杜居士路因”號就以一發190mm炮彈還以顏色，這枚炮彈從炮艦“永保”號右舷前方穿入，沿途擊穿所有甲板隔層，一路鑽進鍋爐房才爆炸！
戰後，當時跟在“永保”號後麵的“琛航”號上，一名補充來的海校學員這樣描述接下來的場景：
“永保前方中彈，隨後劇烈哆嗦起來，煙囪周圍冒出大量黑色煤煙，一開始沒有看到火光，我還以為是交通艇在燃燒，不過它慢慢停了下來，我們不得不打左滿舵，從永保身邊繞過去，但當我們平行的時候，永保爆炸了……”
炮彈引發“永保”號鍋爐爆炸，仿佛有一條火龍從其艦體中部擊穿甲板竄上半空，這艘標準排水量1260噸的炮艦迅速淹沒在濃煙和烈焰之中，各種細碎的零件被拋向天空又如雨般灑落，甚至造成“琛航”號上5人受傷。
事後隻有1名幸存者遊泳回到岸上，另有兩人被福建地方水師的福船救起，包括臨時上艦補充缺額的海校學員在內，110名官兵中有107人陣亡。
“永保”號的沉沒不僅使明軍損失了一艘主力艦，還是法軍反攻的號角。
趁著明軍主力圍攻“杜居士路因”號的機會，其他8艘法艦全部進入馬尾港，周邊的岸上炮台和明軍第二艦列發炮阻擊，但5艘小型炮艦上區區10門70磅前膛炮無法給法軍造成任何威脅，海岸炮台的18磅紅衣炮就更不用提了。
8艘法艦轉向後，立刻以側舷全部火力轟擊明軍，熾熱的火力迅速淹沒了單薄的明軍第二艦列。