自弘治十二年始，由皇太子主持，親自對馬政的官員係統進行梳理，也重新政整治了全國的官牧馬場。
在京師，他支持太仆寺卿梁儲對行政機構進行改革，太仆寺統管全國官牧馬場，包括養馬、調度、輸軍等等各個流程，也不再分設各監，而以‘司’來進行條線管理。地方則設行太仆寺，直接向中央的太仆寺負責。
在地方，他則支持楊一清全麵整頓陝西各處官牧馬場。
春月草長，縱馬於苑。迨冬草枯，則收飼之。至弘治十七年，
陝西馬政在楊一清的治理下已經煥然一新，他自己上疏：臣遍曆其地，酌定三等，開城、安寧為上苑，歲馬可二萬匹；廣寧、萬安為中苑，歲可八千匹；清平、黑水為下苑，歲可四千匹。
朱厚照還記得呢，弘治十二年時，陝西馬場隻有兩千多匹馬……
除此之外，苑馬場也在增加，今年就在平涼府新建了一處安定苑，也是可以歲馬兩萬匹的上苑。
數字的確是漂亮了一點，
其實曆史上，楊一清就是署理陝西馬政非常得力，永樂年間全國有96苑官牧馬場，至明末時隻餘9苑……從陝西來看，永樂時設有24苑官牧馬場，弘治時隻餘6苑，加上今年新增設的，7苑……
這麽慘烈的數據背後，在弘治後期到正德初期，楊一清署理馬政期間，馬政的情況竟然大有改善。
不過，等楊一清離任後，僅十來年後的嘉靖年間，陝西馬政的情況又都恢複原樣。
當然，盡管官牧馬場的情況大有改觀，但馬匹總量不足的總特點沒有改變。
楊尚義的騎兵部隊更是要那種可以戰鬥的精壯馬匹。
不止如此，實際上騎兵部隊看到的是一匹馬，一旦戰鬥，後麵得有三匹馬跟著作為保障，
首先是戰爭中的馬匹傷亡很大，
其次馬所需的糧食也很多、而且很精，需要運輸……基本上一匹精良戰馬的糧食，可以養活25個人。