相傳，佛祖釋迦牟尼圓寂前曾經塑造過三尊等身塑像，並親自為其開光，分別是其八歲、十二歲、二十五歲等身塑像。佛祖曾說過，見這三尊塑像如見佛祖本人。其中，二十五歲等身像是最高大的，但是它不幸遺失，早已不知去向。
然而，讓西藏人們感到無比自豪的是，佛祖的另外兩尊等身像都被人帶到了西藏：其八歲等身像由墀尊公主帶入吐蕃，鬆讚幹布為其建有大昭寺；其十二歲等身像由文成公主帶入吐蕃，鬆讚幹布為其建有小昭寺。
小昭寺又名上密院，藏語叫居堆巴紮倉，與大昭寺並稱拉薩二昭，它位於今拉薩城的東北部。
相傳，文成公主曾帶著十二歲的釋迦牟尼等身像進入吐蕃。一天，她乘坐的木車陷入了沙地之中。
她通過推算，得知此處是龍宮所在地。所以，她決定把釋迦牟尼佛像安放在此地，並修建一座寺院來供奉它，如此既能震懾龍魔，又能使國運昌盛。
文成公主在那裏主持修建的寺院，就是後來的小昭寺，它與大昭寺同時開工、同時告竣，同時開光。為了建設小昭寺，文成公主還特地用了從內地帶來的能工巧匠，以漢地廟宇為模式，結合藏地建築特點，建成了極為壯觀的重樓疊閣。小昭寺的整體建築，經過一年時間建設而順利竣工。
隨後，鬆讚幹布舉行大慶筵，為之開光，聲勢浩大、壯觀。小昭寺門麵向東方，寄托著文成公主對家鄉的思念。
吐蕃百姓為了表示敬意，就在佛像前獻上了很多貢品。按傳統佛教的習俗，供奉佛祖和菩薩的貢品有六色，即花、塗香、聖水、瓦香、果品、佛燈。可是，在草枯花逝的時節，人們無法采擷鮮花，所以工匠們就獨出心裁地用酥油塑造了一束花獻於佛前。從此以後，酥油花就成為了一種藏傳佛教特有的貢品和藝術。