在父親離開後，瑪利亞替他照料小山莊和花園，雖然她從未料理過世俗的私有財物。在給父親的信裏，她仔細地記下了賣掉的水果有多少、因冰雹和被偷竊損失的葡萄有多少。為了安慰父親，她又將園丁寫給她的信重述了一遍。
她告訴伽利略： “你的母驢在主人走後，從來不讓任何人騎。鴿籠裏的兩隻鴿子已長大，園裏的豆莢也等著你來摘。”
瑪利亞的來信裏充滿了思念之情：“當你在羅馬的時候，我希望你在西恩納。現在你在西恩納，我想你很快就會回阿切特裏來的。我相信上帝會安排的！”
瑪利亞在一封信裏提到一些貧民需要他的幫助，她也提到修道院裏的另一個修女丘薇亞，說她是佛羅倫薩最可愛的女孩，才23歲，現在患著肺癆，奄奄一息。瑪利亞從未抱怨過自己糟糕虛弱的身體，但現在，這個勇敢聖女的勇氣也開始減弱了，她絕望地哭泣，祈禱在死之前能再見父親一麵。
這個祈禱實現了。皮柯諾明尼大主教和其他幾位有影響的人，請求準許伽利略回到阿切特裏，回到家人身邊。這個建議獲準了，前提是伽利略在未獲批準前不得前往佛羅倫薩。住在阿切特裏期間，除了去修道院做彌撒及看望女兒外，其他時間不許離開住所，不得在住所接待朋友或聚會，不許舉行任何科學講演。
事實上，即使沒有這些限製，伽利略也知道，審判會隨時都在監視他的一言一行，他的任何小動作都會被報告羅馬。但現在他已經別無他求，隻希望能再見一眼瑪利亞。
伽利略告訴瑪利亞，他將於拘留五個月後獲準回家。她的回信卻叫伽利略吃了一驚，她太虛弱了，她寫道：“我不知道我還能不能等到那一天，也許上帝會恩準我這麽一次。”
對父親的愛支撐著她的生命，終於，在1月間的一個淒冷的日子，父女倆在修道院的一間接待室相見了。瑪利亞穿著寬大的修道服，瘦骨如柴，但她的眼中仍閃爍著慣有的溫柔光芒。他們談了許多事情，但有一會兒，他們都安靜了下來，兩人一直都沒有再說話，直到鈴聲召她去夜禱。