1778年6月，安娜的身體壞到了極點，當時的醫療條件很有限，想要痊愈幾乎是癡人說夢。7月3日，她在一次大量放血之後，永遠離開了人間，享年五十七歲。母親從生病到去世，莫紮特一直隨侍在側。第二天，她被葬在巴黎，哀悼者有莫紮特和他的一位小號手朋友。
母親的去世使莫紮特第一次感受到深切的悲哀，葬禮那天晚上他接連發出兩封信，其中的感情相互矛盾卻也相互補充。
第一封信是給他父親和姐姐的，開頭這樣說：“親愛的母親病得很重……”他並沒有如實告訴父親和姐姐，母親已經去世的消息，這種隱瞞我們可以理解。接著，莫紮特為了安慰父親和姐姐關於母親病重的悲傷和擔憂，把這封信轉成了閑談式的愉快的風格，詳細地描繪了他的《巴黎交響曲》的演出和他在歌劇方麵的機會等。
第二封寫給他在薩爾斯堡的朋友，莫紮特請他把真實的情況告訴父親和姐姐，他寫道：“這是我有生以來最悲哀的一天。母親病危時，我向上帝隻乞求兩件事：讓她走得安詳一些，以及在她走後，給我力量和勇氣。”
幾天之後，不知道是不是上帝聽到了莫紮特的祈禱，他恢複了工作，為他的《巴黎交響曲》重新寫了一個較為快樂的慢樂章，並且作了一首新交響曲。
這時，利奧波德已經知道了妻子去世的消息，他寫信來詢問莫紮特。莫紮特的回信裏說，母親臨終時“極為安詳而美好”，他感覺到“在那一刻，母親似乎變得很快樂。現在，她也確實比我們快樂得多。我曾在那一刻有過希望和她一同離開世界的想法”。
利奧波德對妻子的去世自然十分悲傷，他在信中開頭說：“我的眼淚幾乎使我無法下筆。”但是，他認為這在某種程度上是上帝的安排，任何人都無法改變，隻能承受。莫紮特那種想要和母親一起離世的念頭才是他此時最在乎的，他不能容忍自己費盡心血培養的精品就這樣打碎，他在信的末尾提醒兒子：“無論如何不要失去你現有的任何東西。”