1789年4月，莫紮特欣然接受一位貴族學生的邀請，陪伴他前往普魯士首都柏林一行。旅行對於處在憂慮和痛苦中的莫紮特來說，自然是一件緩解心情的好事。旅途中，他曾在萊比錫等城市舉行了音樂會，吸引了當地很多熱情的觀眾。
他在萊比錫曾拜訪聖托馬斯教堂和約翰·塞巴斯蒂安·巴赫的故居，並在那裏逗留了很長時間。莫紮特彈奏了巴赫曾彈奏二十五年之久的一架風琴。巴赫以前的學生也是巴赫的繼任者約翰·多爾斯認為他已故的老師所受的重視可以在莫紮特的身上看到。令多爾斯感到意外的是，如此一位現代的作曲家竟然會對巴赫棄之不顧的作品感興趣。他為了對莫紮特表示尊敬，曾領導合唱隊用八部二重合唱唱了一首巴赫的教會讚美歌。一位旁觀者寫道：“莫紮特在聆聽的時候，靈魂似乎在耳朵裏。”
攻占巴士底獄（油畫）
一位偉大的作曲家在聽另一位名家的音樂時的表情，是非常動人的。
會拉大提琴也愛好音樂的普魯士國王歡迎莫紮特的到來，並委托他作幾首弦樂四重奏和幾首奏鳴曲。
在回程途中，莫紮特再次來到萊比錫，他在這裏舉行了一場音樂會，音樂會中管弦樂的音量大到驚人，幾乎令人忍不住擔心那座舊建築物會不會被震塌。當時的情況雖然熱烈，但是金錢的收入仍舊很少。他寫信給太太說：“你應該會對我能夠再度回家，比我帶回來多少金錢更感到高興才對。”
6月，他回到維也納。
康絲坦茲又懷孕了，而且還在生病。她在維也納郊外的一處礦泉進行一連串的治療。莫紮特又向普契博格求救：“上帝！我的境遇很慘，即使是我的頭號敵人，我也不希望他遭遇如此的境況。上帝！我無法表達我的謝意，我又得向你提出新的懇求。”