就在這次召見的次日，崇禎皇帝沒有經過內閣，就直接召見了兵部代理尚書陳光祖，下達了第一道命令，那就是把他的署理部事的署理給去掉了。
兵部署部事陳光祖正式去掉署理，轉為正式的兵部尚書了。而且晉封為少師，成為從一品的官員。
對於這忽如其來的人事任命，陳光祖有點發蒙。兵部尚書是正二品，侍郎是從二品。陳大人是以兵部侍郎的身份代理部長，就在今天來上朝之前，還是一名從二品的官員，這一眨眼的功夫就連升兩級，成了從一品。
官升的太快也不一定就是好事，陳光祖忽然成了一品大員，這本來應該高興的事，他卻高興不起來，因為他最近一直在兵部料理日常的事務，並沒有什麽特殊的功勳，這驟然的越級晉升，一切都來的太過於突然了。
陳光祖慌忙跪下磕頭：“臣何德何能，蒙受如此不次超遷，萬望陛下收回成命。”
崇禎臉上的表情很嚴肅，看不出來他有任何的情緒變化，他隻是淡淡的說：“陳愛卿，不必推辭。你在朝廷中，多負辛勞，如今又在署理兵部的任上兢兢業業，這些朕都看在心裏。”
頓了一下，崇禎又說：“兵部乃是我朝的重衙，如果不是信得過你的話，朕是斷然不會讓你來做這尚書的。陳愛卿，朕來問你，前幾天，朕下旨訓斥了山海關都司淩雲殺良冒功，鑒於前番功勞，不予重責。僅僅褫奪官位貶為平民，並把他的三個部下押解進京，這件事是你兵部辦的。朕問你，那三名百戶現今如何？”
崇禎應該算是國家的最高首腦，也算是全國軍事力量的最高統帥了，他親自來過問三名百戶小官。這讓陳光祖有些猝不及防。但陳光祖一直很回護那三名百戶。這事情，看來是應該和皇帝實話實說的了。
想到這裏，他又一次跪下說：“啟奏萬歲，臣有罪。請陛下重責。那三名山海關百戶押解到京以後，臣一堂未過，並且很是善待他們。”