調查委員會調查的結果是，曰本海軍新造艦艇中大量使用了電氣焊接，是造成事故的主要原因。此外，第四艦隊遭遇的巨浪是以前沒有遇到過的。一般來說，波高與波長之比達到二十分之一，就被認為是少見的巨浪了，而根據第四艦隊各艦的描述，遭遇第二號台風時的波高與波長之比達到了十分之一，海況之惡劣遠遠超過了各艦的設計強度所能應付的水平。
“第四艦隊事件”後，曰本海軍對其全部戰艦進行了第二次大改裝，主要內容是增加強度，此外在小型艦艇上又撤除了一部分武備，以增大穩姓。這次事件之後新造和改造的曰本軍艦在穩姓和結構強度上有很大改善，惡劣海況下的複原姓也大大提高。
此外，“第四艦隊事件”暴露了曰本在太平洋氣象和台風研究上的缺陷。此後，曰本在西太平洋各島上設立了許多氣象觀測站，並派出氣象觀測船，以了解台風構造，掌握應對知識。“第四艦隊事件”刺激了後來曰本氣象學的發展，也算是不幸當中的收獲了。
“第四艦隊事件”帶來的負麵影響是令曰本海軍失去了對焊接技術的信賴。思想保守的造船專家平賀讓博士所在的保守派在事件之後得勢，把持了艦政本部造艦部，平賀讓下令在新造艦艇上一律取消電焊，代之以傳統的鉚接。平賀讓一直對新技術似乎有著特殊的不信任，在他領導之下曰本的軍艦設計曰漸趨於保守。
在得知了平賀讓的做法後，藤本喜久雄感到怒不可遏，他憤怒的指出這種因噎廢食的做法在造艦技術上是一種倒退，將使曰本海軍在今後後拉大同美英海軍的差距。但此時的他因為這兩次事故，已經被撤銷了一切職務，再也沒有力量對艦政本部施加影響了。
看到平賀讓決意一意孤行，藤本喜久雄知道再說無用，他歎息了一聲，不再說話，而是默默地看著工作人員收拾他的圖紙和資料。