卻說司馬休之、魯宗之、韓延之等曾奔投後秦。秦為晉滅，宗之已死，休之等見機先遁，轉入北魏，北魏各給官階，使參軍政。休之尋卒，子文思及魯軌等，遂為魏臣。劉裕大索不獲，隻好罷休。晉廷已遣琅琊王司馬德文，與司空王恢之，先後至洛，修謁五陵。劉裕欲表請遷都，仍至洛陽，王仲德謂勞師日久，士卒思歸，遷都事未可驟行，裕乃罷議。晉廷已加授裕為相國，總掌百揆，封十郡為宋公，備九錫禮，裕又佯辭不受。再進爵為王，增封十郡，裕仍表辭。封爵雖崇，終未滿意。更欲進略西北，為混一計，忽由京中遞到急報，乃是前將軍劉穆之，得病身亡，禁不住驚惶悲慟，淚下數行。
穆之為裕心腹，自裕西征後，內總朝政，外供軍需，決斷如流，事無壅滯。屬吏抱牘入白，盈階滿室，經穆之目覽耳聽，手批口酬，不數時便即了清。平時喜交名士，座上常滿，談答無倦容。又食必方丈，未嚐獨餐，嚐語劉裕道：“仆家貧賤，養生多闕，蒙公寵遇，得叨祿位，朝夕所須，未免過豐，此外一毫不敢負公！”裕當然笑允，始終倚任不疑。每屆出師，無論國事家事，悉數委托，穆之極盡心力，勉圖報效。及九錫詔下，穆之未曾與謀，聞由行營長史王弘，奉裕密旨，自來諷請，因此不免懷慚。劉裕諷求九錫，又複表辭，何其鬼祟若此？嗣是愧懼成疾，竟致逝世。比荀彧尚覺勿如。
劉裕失一良佐，恐根本無托，決意東歸，留次子義真為安西將軍，都督雍梁秦州軍事，鎮守關中。義真年才十三，少不更事。關中重地，偏留稚子居守，未知何意？裕令谘議將軍王修為長史，王鎮惡為司馬，沈田子、毛德祖、傅弘之為參軍從事，留輔義真，自率各軍東還。三秦父老，聞裕整裝欲返，俱詣軍門泣請道：“殘民不沾王化，已閱百年，今複得睹漢儀，人人相賀。長安十陵，是公家祖墓（指漢高以下十陵），鹹陽宮闕，是公家舊宅，舍此將何往呢？”裕亦黯然欲涕，隨即慰諭道：“我受命朝廷，不得擅留，諸君誠意可感，今由次子義真及文武賢才，共守此土，汝等勉與安居，諒不至有意外變動呢！”大眾乃退。