大晉帝國在接下來的一段時間，從**洛陽到中原各地郡縣，主要精力都在清算世家地方。太子培育起來的新興學子和關中一些新興勢力各個全力以赴。因為這是他們難得的進入國家權力中心的機會，隻有把那些倒黴蛋珠連的越多，他們的機會就越多。
這可是機不可失，時不再來啊！
在兗州、徐州、青州、司州、豫州等地，一個個世家大族被趕出世代居住的地方，一個個被牽扯到叛亂中的世家官員被罷官去職，趕出朝廷。
在朝廷大軍的壓力下，沒有哪一個世家敢反抗！因為反抗就意味著身死族滅，朝廷已經消滅了十幾個世家大族，其血腥手段讓世家們不寒而栗，興不起任何反抗的念頭。
僅僅是兗州一地，祖約就攻破了一百多個塢堡，解放庶民、佃戶數十萬人。在這場清算世家的浪潮中，一部分不甘失敗的世家準備拋棄北方的家業躲到南方去。而南方的琅琊王、王敦他們為了增強江東的實力，他們趁機派出人員去遊說北方大族南渡。
當然也不是所有世家願意玉石俱焚，一些有眼光的世家在認清的現實之後，決定接受太子的條件，讓家族進行轉型。他們這些人主動交出大部分家產和全部佃戶以及部曲後，跑到洛陽當起了愚公。
而司馬遹為了保持帝國政權、經濟的基本穩定，司馬遹又讓太傅出麵力保了少數‘開明’世家。隻是將他們的家產、佃戶沒收入庫，同時司馬遹為了安慰人心動蕩的世家，又將那些識時務的世家子弟送到關中長安大學進行深造。
太子這一舉動才讓那些剛剛投靠過來的世家安心下來，這段時間世家大族看到那些出身新城大學、長安大學的學子們紛紛得到朝廷重用，要說不羨慕那是不可能。由於太子對世家子弟有偏見，除了極個別的人會得太子青眼外，其他人若想出人頭地就必須再回爐重練。