二十世紀最後的夏天。那一天人類第一次知曉，自己並非地球唯一的支配者。
地球上出現了巨大生物“怪獸”和能夠驅逐怪獸的強大的存在——“哥斯拉”。和怪獸的戰鬥持續了半個世紀，人類不斷失敗和逃亡，最終不得已實施了逃離地球的計劃。
2048年，在外星種族“艾克西夫”和“畢魯薩魯多”的幫助之下，由中央政府管理下的人工智能篩選出的人類搭乘恒星移民船“阿拉特拉姆”號向11.9光年外的“鯨魚座塔e星”前進。但是，曆經長達20年的旅程終於到達的塔e星環境比預計的還要惡劣，並不適合人類的存續。
擺在人類麵前的選擇，似乎不多了……
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以上這些文字在大雄麵前閃過，輔之以一些飛速掠過的畫麵。他大致辨認出來，這是一場慘烈的戰爭，開戰地點應該是地球上的喜馬拉雅山。無數火炮、激光攢天而起，向著那個山一樣的目標飛去，但最終都隻打出了幾個不痛不癢的火花，沒有什麽用處。
下一個瞬間，大雄感覺一陣顛簸，他被傳送到了一個狹窄、黑暗的空間。
“……他沒有騙我，這一切都是真的……”
大雄有些驚愕地扶了一把牆壁，他驚訝地發現，自己竟然身處在方才片頭cg中出現過的阿拉特拉姆號上。透過飛船的密封窗，大雄能看到外界無垠的星空，以及那片以“黑暗”為布景的宇宙空間。
這……是一場貨真價實的冒險啊！
嚐到久違的新鮮感，大雄的呼吸變得急促了，他甚至能感受到自己的心髒在狂跳！其實在八年前，這種冒險對他來說就像吃飯喝水那樣頻繁，要論心理素質，他比那些第一次被傳送的新人強不知道多少……隻不過那時，哆啦A夢會確保他們的安全問題，所以做什麽都有些肆無忌憚。而現在……他不在了，大雄唯一能仰仗的就隻剩下他自己。