由於楊嗣昌的督師，明朝政府在對農民起義的軍事上有了一些起色，暫時還居於優勢。到崇禎十三年夏秋之間，將張獻忠和羅汝才為首的幾支農民軍逼到川東，四麵圍堵，大部分已經投降，羅汝才也正在準備投降，被張獻忠及時阻止。張獻忠為擺脫明軍壓力，拉著羅汝才奔往四川腹地。李自成銷聲匿跡，不再為人注意。然而這隻是局部的表麵現象。實際上，明朝政權從來沒有像在崇禎十三年夏秋間陷入全麵的深刻危機。從軍事上來看，十三年來崇禎一直陷於既要對付大規模農民起義，又要對付日趨強大的清朝的軍事壓力。到了目前階段，四川戰事勝負未決，前途變化莫測，而山東、蘇北、皖北、河北南部、四川北部和河南、陝西各地，到處有農民戰爭。山東西部、南部和徐州一帶的農民大起義，嚴重威脅著明朝中央政權賴以生存的南北漕運。在山海關外，崇禎為防備清兵再次南下，催促洪承疇指揮十幾萬大軍向鬆山、杏山和塔山一帶進兵，謀解錦州之圍，但是軍心不齊，糧餉補給困難，幾乎等於是孤注一擲。從財政經濟來看，長江以北的半個中國，尤其是黃河流域各省，由於長期戰亂，官軍紀律敗壞，燒殺**掠，官府橫征暴斂，加上各種天災人禍，農業生產受到極大破壞，人民死亡流離，往往村落為墟，人煙斷絕。到了十三年夏秋之間，不但黃河中下遊和淮河流域各省的旱災和蝗災特別慘重，而且朝廷所依賴的江南也發生了旱災和蝗災，蘇州府等地糧價飛漲，城市中發生了多起搶糧風潮。在這種情況下，朝廷的軍費開支反而增加，所以財政方麵確實快到了山窮水盡地步。軍事和財政經濟兩方麵的嚴重危機，加深了朝廷上的政治危機，一方麵表現為崇禎皇帝因借助軍餉問題同皇親、勳舊展開的明爭暗鬥，另一方麵因對拯救危亡的看法不同，崇禎同一些朝臣發生直接交鋒。