不過阮元卻也無法因此輕鬆下來，秋去冬來，阮元多方延引名醫為阮承信診治，也讓阮承信的情況有了些好轉，至少當日那種巨痛之感已然漸去。但阮承信卻一直感覺雙腿無力，無法正常行路，醫生也言及阮承信之病，究其根本乃是年邁體衰，血行不足之故，隻得臥床調養。一家人平日自是盡心照顧，卻始終不能讓阮承信複原。
嘉慶九年之冬，阮元也繼續清理杭州水道，將城中流福溝漸漸疏浚，城外西湖河口，以及西湖淤泥多處，也都一一開掘清除。到了冬末，杭州水道終於漸有起色。這時葉機也因連番平盜有功之故，被阮元再一次叫到了杭州。
“葉教諭，去年你協助剿捕海寇，辛苦你了。”阮元主動對葉機道：“而且這兩個月，你在溫州協助李鎮軍攔截黃葵，也自有功，憑你這些功績，我足以上報皇上，若是沿海知縣有開缺之位，便讓皇上優先補你為知縣，如何？”這時溫州總兵換成了李景曾，阮元便以李鎮軍稱之。
“中丞，下官為教諭不過兩年，所辦不過該辦之事，中丞卻為何要如此提拔下官呢？”葉機也自謙道。
“葉教諭，你所辦之事早已超過了許多碌碌無為的知縣，眼下沿海之地最缺能人，你在那裏也算頗有人望，讓你做知縣，也能讓你在那邊更好的施展自己才幹不是？”阮元的想法倒是非常堅定。
“既然如此，那下官也謝過中丞了。”葉機對阮元拜道。
“且慢，你不用這樣著急謝我，今日我叫你來，也是有一樁不解之事，還望你這一次可以對我說一句實話。”阮元的言語卻突然鄭重了起來，續道：“四年前我與你在海濱相識，我曾問過你為何身為一介生員，卻頻繁在沿海各府縣與人交遊，你說讀萬卷書，不如行萬裏路，這話我可以信你。但我這幾年卻也發現，沿海不少保長甲長與你關係都不錯，雖說其中也有家世貧寒之人，可能做到裏長甲長的，大多家資還算豐厚，我這也沒說錯吧？葉教諭，你當年多與海濱富戶有所交往，恐不是行萬裏路這樣簡單吧？若是你果然有了難為之處，我看在海濱，可以一呼百應啊？”