不覺之間，已是嘉慶十二年正月，阮元的居家守製也到了最後一年。阮元自也清楚，若是終製之後再次任官，自己家中文卷便無暇整理，尤其是自己六年巡撫浙江，軍政要務記錄甚多，若是這些文卷日後能存，不僅自己功業可以流傳，對於後人為官治事多半也有益處。便與阮亨一道，尋了阮亨妻弟王豫到揚州來，一同編訂杭州文稿，書成即命名為《瀛舟書記》。看著阮元撫浙六年，治軍安民之事，王豫也不禁歎道：“芸台先生，今日看先生書記，我才知道，以前我也算飽讀經史，總是想著能成就一番功業，可事實上，我不過是井底之蛙罷了。原本與先生一家不識，隻知道先生精於漢學，所長盡是經術之才，可這樣一看，先生調度兵船、賞罰將士、籌集糧餉、救災安民，竟是樣樣精通，能和仲嘉結緣，又認識芸台先生，真是我不知幾世的福分了。先生，國朝有您這般人物，百年養士，方是有了大成啊。”阮元居家之時，自起一號為“芸台”，亦有“雷塘庵主”之稱，此後半生，親友弟子便多以“芸台先生”稱之。
“柳村，這本就是我所該做的啊？”王豫號柳村，故阮元也以號稱呼王豫：“讀書之人若是不願仕官，便與你所言一樣，盡心經史，也沒什麽不好。可我當日升遷要比同列快了些，沒幾年工夫，這就要主持一省政事了。當時我也是全無經驗，皇上與我說起這事之後，我一連數日都是忐忑不安，生怕自己一不小心便犯了大錯，當時也是遍尋恩師舊友，悉心求教。後來也是一邊學，一邊做，久而久之，就自然熟悉了啊？其實這本就是聖賢之道，聖人雲，達則兼濟天下，我為官十載便得巡撫一方，自然是‘達’了，而且我便觀聖人之言，孔孟言事之要，便在一個‘實行’。若是有了如此地位，卻隻做個讀書治學的學究，那才是真正有愧於聖賢之教了。”