很快，廣興的死訊便傳到了杭州，而朝廷對於阮元的處分也一並送達。阮元自也清楚饋遺之事，自己多有遺憾，如今能以降級留任的結果告終，已經超出了自己的預料，心中的一塊石頭也就這樣落了地。而蕭山水塘經過一月治理，也已經漸有起色，阮元、焦循等人對蕭山水利做了規劃，選出王宗炎、孫上驤等數名精於興修水道的紳士，取代了先前平庸無為的幾名劣紳，繼續在蕭山辦理治水事宜，眼看規劃之事告一段落，其餘諸般隻需依次實行，阮元便也在正月之末回到了杭州。
二月方至，阮元也得到消息，經過多年疏浚修護，西湖水利終於興修完畢，而先前自己準備在西湖之中修築的小島，這時也已經完工，杭州百姓感念阮元治水救災、寬政恤民之德，便將這處小島稱為阮公墩。阮元也自乘小舟，在西湖中觀賞著這座新成的“阮公墩”，隻覺這座小島不僅有分遏水勢之利，更是同南麵的三潭印月，東南的湖心亭成鼎足而三之勢，三島相映成趣，大有傳說之中蓬萊三仙島之感，阮元眼看西湖風景秀美如斯，自也是無限愜意。
數日之後，阮元又於焦循、張鑒、許宗彥一道，前往了杭州之西的靈隱寺。這時因朱珪、翁方綱文集校刻完畢之故，阮元為存其圖書刻版，特意找到了靈隱寺商議貯藏文集之事。靈隱寺中僧侶多識阮元之名，自也樂意效勞。阮元謝過各人之後，自覺難得有個清閑之日，也帶著三人一並在靈隱寺中遊覽，觀賞寶刹風景。
可這日看著看著，阮元卻忽然多了一個想法，對三人道：“裏堂、春冶、積卿，你們看，這靈隱寺外麵香火不絕，可裏麵這些房舍，卻都是清幽之所，現下空曠的卻也還有幾間。若是隻將恩師和翁先生的文集存留於此，倒是大材小用了啊。所以我倒是想著，咱們也尋個時日，每個人向這靈隱寺捐一些書，咱們捐了，杭州、甚至整個浙江的士人，也一定會望風而從，到時候，說不定可以在這靈隱寺，再建一個文瀾閣呢。”