京城之中諸多人事變化，十月之初便已傳到了阮元行船之中。但這時的阮元，因漕船尚未抵達淮南之故，一時也無暇思索其中內情，隻是想著桂芳也算是自己學生，雖出身覺羅，家境卻頗為貧寒，這次能靠自己才幹躋身軍機大臣之列，也算是“與有榮焉”了。十月中旬，漕船終於陸續渡過黃河，漸次南下。萬幸的是，經曆了天理教這一亂，五千餘艘漕船依然得以全數南下，平安返鄉。
而這一日到了淮安之時，阮元卻意外發現，百齡和黎世序都已經抵達了漕運碼頭，正在岸上等待著自己歸來。
“哈哈，阮漕帥，這一次你可是立了大功啊。”看著阮元一行漸漸登岸，岸上的百齡也是如沐春風，主動迎了上來，對阮元笑道：“阮漕帥，此次豫東之亂，我和黎總河也都聽說了，真是沒想到啊，事起突然，沿漕又不能預先布置，我那時在江寧想著，這漕運要道，可不能被賊人截斷了啊？所以我也是連夜下令，發兵駐防淮北，可你還在山東，我護衛不到啊？那幾日我也是夜不能寐，唯恐你們有個萬一，被賊人劫了運道可如何是好？真沒想到，阮漕帥居然臨危不亂，這幾千艘漕船，幾十萬兩銀子的商貨，竟是一點不落的被你帶了回來！伯元，若不是朝廷定例所限，這件事我想著，是真要給你記上一功，才對得起你護漕之力啊。”
“百總製……不，百中堂，您這也太客氣了，下官身為漕運總督，護送漕船不受盜賊侵害，本就是份內之責，怎麽能因為我做了本就該做的事，而受到額外嘉獎呢？國家賞罰分明，我依職分護漕南歸，便如先前曆任漕帥督漕一般罷了。”阮元自然清楚百齡已經升了協辦大學士，故而改了稱呼。麵對百齡如此盛意，阮元卻也一時不知如何應對，各人自然都清楚，就在三個月前，百齡還因為築閘之事，與阮元有過爭執，這時百齡竟全然變了態度，主動迎接阮元南歸，若是阮元記恨先前舊事，對百齡冷言冷語，那便是阮元心胸狹隘，與同列不相能了。可若是阮元謙辭以對，也未免顯得有些軟弱，讓人以為麵對百齡強勢，自己竟隻得步步退讓。是以阮元沉吟片刻，也隻好用了折中之法，僅言自己護漕之舉，出於職分而已。