長崎的著名土特產也有很多。
玳瑁手工藝品是長崎最具有代表性的手工藝品，其中女性飾品尤為出眾，如耳環、項鏈、手鐲、發卡等，加工繁複、色澤透明為上品。
玻璃製品碧多蘿也相當受歡迎，鮮豔而又清透的色彩，加上纖細又光滑的觸感，是做工細致、精巧優美的工藝品。“碧多蘿”源於佛郎機語“VIDRO"。
因為玻璃的製取溫度要1200-1600攝氏度，而且透明玻璃燒製有一定工藝難度，所以此時扶桑的玻璃都來自蘭國商館，扶桑的手工業者購買玻璃後再進行二次加工——添加色彩和重新塑形，有名的玻璃製品有江戶的江戶切子、長崎的碧多蘿。
“雲仙燒”是用“雲仙地獄”（火山）的土石上釉燒製而成的，具有古樸的鄉土氣息。
古賀玩偶類似於中國的泥人，造型是人物或動物。
長崎出產的風箏多種多樣，作工精良，尤其是壹岐的"鬼臉風箏"，色彩豔麗、造型獨特，遠近知名。
三川內陶瓷器和波佐見陶瓷器具有悠久的曆史。三川內陶瓷器的特點之一是用透雕的工藝將產品製作得精細優美，具有很強的裝飾效果。另外，獨特的純白和纖細優美的藍釉花紋也別具特色。而波佐見陶瓷器主要是用於餐飲的器具，色彩淡雅，製作精美。這些陶瓷是獻給將軍等大人的貢品。
長崎有漫長的海岸線，出產珊瑚和珍珠，經過加工的珊瑚和珍珠華貴精美，也是此時的珍品。
直秀苟了兩天，沒發現盯梢和可疑人物，感覺安全了，這才帶著兩個學生去取書。德弗裏斯醫生的弟子叫中村田一，開了一家蘭醫診所，據說在當地名氣不小，直秀順利地見到了他，交談之後私下找機會一個人的時候也順利地拿到了書，鼓鼓的一個包裹。因為以後還要通過中村來和德弗裏斯保持聯係，所以直秀的謝禮頗為貴重，包括一把製作精美和扇和兩冊最近發行的蘭學醫書。