然後教皇就想了一個辦法，用大量的金錢收買了布魯諾的一位朋友，接著布魯諾的朋友用著花言巧語將之誘騙回國。在一五九二年的五月二十三日，羅馬的教皇派人逮捕了布魯諾，將他囚禁在了宗教裁判所的監獄裏。
雖然這個時候的布魯諾鋃鐺入獄，但他依舊不改他自己的初衷，在他看來，真理終將戰勝邪惡。可這個時候，已經有很多的先進人士認為布魯諾的觀點是正確無誤的，故此教會想讓布魯諾撤回他的觀點，因為這對他們教會，乃至這個世界的影響太大了，故此對在監獄裏的布魯諾使用了殘酷至極的刑罰，想使其在這些非人可承受的痛苦折磨麵前屈服，但這些非人的痛苦與折磨，雖然將布魯諾折磨到不像人形，滿身的血汙，但他高貴不屈的靈魂，依舊沒有讓布魯諾這位勇士屈服。
教會的人知道他們無法令勇士屈服，故此就轉為利誘。對布魯諾說著，隻要你公開表示認罪和懺悔，我們就給你安排一個令所有人羨慕的高位，這樣你就可以過上窮奢極欲、荒**無度的生活，更是高高在上，萬人敬仰。但是布魯諾卻輕蔑的開口：這正是體現了你們內心的虛弱和恐慌！這個時候利誘布魯諾的主教一下子就羞惱成怒，立刻就大聲吼道：你執迷不悟，等待你的隻有火刑。布魯諾卻非常平靜的開口：真理麵前，我絕不退讓半步。
但是主教明白，他自己目前雖然很是憤怒，但還是不能殺掉布魯諾，因為這種影響實在是太大了。畢竟教會之前就發生過很多類似的事件，導致人民已經不再對教會持有之前的那種虔誠了，所以這個時候要是按照以前的方法來做的話，那麽隻能向整個世界宣布，他們教會再次做錯了，這種事情絕對不能發生，因為一旦發生，那麽就是承認布魯諾是正確的，這樣後果就是將失去更多的信徒，如此對他們教會太不利了，更加可怕的是，布魯諾的言論是要顛覆整個世界的概念，這絕對也不是開玩笑的。