經過了劉耳枝這一鬧,回到兵部衙門，熊明遇仍是一身冷汗，哪裏還敢再怠慢，快馬嚴令朱大典迅速進兵，務須徹底平息叛亂。
接到命令時，朱大典已抵達山東青州。他原是奉熊明遇之命，過來了解真相的。
閱罷命令，朱大典道：“看來，皇上震怒了，不然，熊兵部不會這麽急。不過,再急，有些事情還是弄弄清楚的好。
據大典所知，此次兵變的始作俑者，還是登萊二州的巡撫孫元華，當年，毛文龍駐守皮島的部下嘩變，若不是他不顧眾人的勸阻，非要接受孔有德、耿仲明、李九成、李應元等人，並把耿仲明派往登州，就斷不會有今日。
起因更是可笑,竟是因一士兵強取山東望族王象春家仆一雞，該丁被‘穿箭遊營’。於是士兵擊殺該家仆，事後象春之子不肯罷休，要求查明真相，李九成把孫元化給的買馬錢花盡，恐遭非議,便攛掇孔有德嘩變。
看似可笑，其實還得怪孫元華，明知遼東兵與山東兵素來不和，居然還侵吞兵餉，導致兵餉不足。士兵因與山東人屢有摩擦，縣人皆閉門掩戶。士兵無處覓食，不反才怪呢。”
說到這裏，朱大典頓了頓，接著道：“初遇嘩變，沒有防備，讓叛軍得手，這還有情可原，登州原已獲勝，孫元化卻又在撫與戰之間搖擺不定，以致於失守登州，總兵張可大斬殺其妾陳氏後自盡，自己跟宋光蘭、王徵、張燾等人被俘，虧得孔有德念舊，才得以放還。
之後的救援，更是或畏戰，或不懂兵以物資資敵，或心存僥幸進行招撫，導致賊勢更熾。
畏戰者莫過於原山東巡撫餘大成聞登州已失，卻束手無策，唯閉戶修齋誦經，被人譏之為‘白蓮都院’。另有總兵王洪，在新城鎮戰敗，居然逃跑，迫得楊禦藩不得不進入萊州。
不懂兵以物資資敵者，當屬兵部侍郎劉宇烈。劉宇烈統帥薊門、密雲等地的援兵和義勇鄉兵二萬五千人，兵部還特遣中使送紅夷大炮六門至沙河交付。