就在這一夜，冬木市的火車站上迎來了帶來不幸和災難的旅客，名為衛宮切嗣的魔術師殺手代表艾因茲貝倫家正式進入了聖杯戰爭的戰場。
在魔術師組織‘時鍾塔’有著‘神童’教授美譽的降靈科天才魔術師凱奈斯.埃爾-梅羅伊.阿奇博爾德（Canis.El-Melloi.Archibald），九代魔導血統的名門阿奇博爾德家的長子，帶著自己的未婚妻索拉入駐了冬木鎮最大的賓館，並且將這裏布置成了固若金湯的魔法陣地，魔術工房。
在誓約取得聖杯戰爭的勝利同時，他要將那個敢於偷竊自己的聖遺物的竊賊撕成粉碎！
階職為槍兵的英靈守衛在他的身邊，尋找著自己的敵人。
竊取了原本屬於凱奈斯的聖遺物廢柴魔術師——韋伯-維爾維特卻成功的召喚出了可以說是本屆聖杯戰爭中最強英靈之一的RIDER，曾經名垂青史的偉大帝王亞曆山大大帝，征服王伊斯坎達爾。
發誓要證明自己才能的韋伯隱藏在普通的民居之中，正在充滿頭疼的跟自己腦子裏缺根弦的從者進行艱難的交流，製止他去搶一架戰鬥機回來的欲望。
最古之王，擁有世間一切財富的金色王者，吉爾伽美什在天亮的時候，從遠阪家的魔術工房中被召喚出來，受到了遠阪時臣恭謹且周到的服侍，並且對聖杯戰爭這場‘遊戲’產生了興趣。
在麵對真正的強者，遠阪時臣不惜放下身段，反過來作為從者的臣子，遠阪時臣心中想要的，隻有勝利和聖杯。
四個小時之後，魔術師家族艾因茲貝倫家所製造出來的人造人——承載亡魂和聖杯的活物容器——名為愛麗斯菲爾銀發女人帶著自己丈夫的從者，登上了目標為冬木鎮的航班。
劍之英靈的真實身份乃是英國最富有傳奇色彩的國王，身負紅龍血脈的騎士少女：阿爾托利雅。
這一次，以獲得勝利為目的，她要用聖杯將自己銘刻在曆史之中的恥辱命運修改-