明軍此次率兵南下的不是姚啟聖，也不是施琅、鄭成功，而是鄭成功之父鄭芝龍，為什麽會派他出戰呢？高一鳴也是考慮很久才做的決定。
鄭芝龍以前做過海盜，後來歸順大明朝，率領屬下嘍囉成為了明末非常強悍的一支水師。鄭芝龍與荷蘭的戰爭很在就開始了，在荷蘭人進入中國南海時候，就與占據台灣的鄭芝龍發生過海戰。
後來在1633年，也就是崇禎五年，鄭芝龍在福建沿海，再次與荷蘭人大戰，這就是史料記載的明末“金門海戰”，此戰擊潰了荷蘭東印度公司艦隊，從此明朝沿海綏靖。
鄭芝龍在東南沿海名望很高，鄭成功能夠一舉驅逐荷蘭人收回台灣，全賴福建沿海居民相助，沿海居民相助他很大一部分原因也是因為鄭芝龍。
鄭芝龍當年之所以到台灣與朝廷分庭抗禮，是因為當時閩南發生了嚴重旱災，遍野赤土，許多村落連草根樹皮都被吃盡了，朝廷那時候一直將注意力放在北邊，自顧不暇，所以鄭芝龍就招撫了泉州受災的百姓好幾萬人去了台灣耕田牧海，但是那時候明朝實行嚴格的海禁，所以他的行為不被明朝容忍，就將其列為不法分子、海盜之流了。
不過在這期間，鄭芝龍對百姓很仁慈，從不枉殺百姓，還大力救濟貧苦，帶領百姓抗擊荷蘭人，威望比官家還高，由於鄭芝龍的威名遠播，那時候做海上貿易的都會打著他的旗號。
另外，鄭芝龍閱曆很豐富，到過國外很多國家，精通盧西塔語、日語、荷蘭語、西班牙語、葡萄牙語等多國語言，絕對是航洋方麵的專家，因此高一鳴思來想去還是讓他擔了此次重任，為此還把閻應元派給他做了副將。
他們第一站選在了舊港，因為靠近南海的占城雖然海路不通，但是陸路去大明朝朝貢的舉動一直沒斷過，倒是距離南海稍遠的浡泥、滿刺加、真臘、邏羅、錫蘭等西邊的小國斷了朝貢，這些國家鄭芝龍之前大多都曾到訪過，這一次算是故地重遊。