在這場接連出現的彈劾事件中，張居正能做的隻有上疏皇帝，請求回鄉丁憂。而萬曆皇帝也明白張居正的意思，因而兩個人配合得十分默契。張居正一再上疏，而萬曆皇帝則一再挽留——對於張居正的上疏，萬曆皇帝一一駁回。其原因隻有一套說辭：先生是先皇認定的顧命大臣，朕心智還不成熟，所以還要依賴於先生，因此先生萬萬不能離開京城。
就這樣，兩人來來回回地折騰，最後張居正也沒有耐心了，他說：“朝中人才那麽多，大家都是忠於朝廷的人，為什麽偏偏我就不能離開呢？”其實，這句話隻是他的牢騷而已，他的本意自然不是這樣的。
而在這個敏感的時期，又有一個叫鄒元標的人站了出來。他上疏稱：“皇上一直說自己心智不成熟，所以還要依賴於張居正，更離不開張居正。但是如果有一天，張居正也去世了，那皇上也不活了嗎？如果皇上一直這樣放縱張居正，那麽時間久了他便會恃寵而驕，甚至連皇上的話也不放在心上了。後人如果都效仿張居正的做法，那麽就有可能發生謀朝篡位的事。”
鄒元標是一個非常直白的人，他的這些話如果放在私下說還好一些，但是他卻將這些話搬到了台麵上。而這樣一來，不僅惹怒了張居正，還惹怒了皇帝。因為他的這番話也在間接地指責皇帝，說皇帝無能，隻能依賴於張居正。最後，在馮保等人的煽風點火下，萬曆皇帝龍顏大怒，說道：“這些話不僅僅是對朕的侮辱，而且還詛咒張先生。打！狠狠地打！”
於是，鄒元標被重打八十廷杖後發配到邊疆。而之前彈劾張居正的吳中行、趙永賢等人也被牽扯其中。吳中行和趙永賢被打了六十廷板，並且皇帝下令將他們貶為庶民；艾穆和沈思孝被打了八十廷杖，發配到邊疆。