中華民國元年一月一日（1912年1月1日），中華民國臨時政府成立，定都南京。蔡孑民任教育部長。許壽裳被蔡孑民邀請到南京幫忙，便找機會推薦周樹人來工作。
“蔡先生，目前一切草創，未具規模，草擬各種規章，日不暇給。我向先生推薦一人，可好？”許壽裳趁工作間隙對蔡孑民部長說。
“你推薦誰？”
“周樹人，我的一個老同學，也是老同事。”
“唔，我久慕其名，未見其人，正擬馳函延請，現在就托先生代函敦勸，早日來南京。”
教育部長同意了。於是，許壽裳從南京兩次給周樹人發函，轉達蔡孑民部長殷切延攬之意，請周樹人速往南京工作。不久，周樹人便來到南京，在臨時政府教育部任職，兩個摯友複又聚在一起。
周樹人和許壽裳，白天，兩人同桌辦公，晚上，兩人聯床共話。老朋友今日重相聚，有說不盡的話。兩個人談起在東京的“伍舍”，一起在庭院裏種花草，一起逛神田一帶的舊書鋪，一起訪銀座的規模宏大的丸善書店，一起到章太炎先生處去聽講；又談及辛亥革命以後故鄉紹興的“革命”情形，實在感到那些事多麽的滑稽可笑。閑暇時，兩人同去圖書館，周樹人借來《沈下賢集》抄錄，後來在《唐宋傳奇集》中所收入的《湘中怨辭》、《異夢錄》、《秦夢記》，就是在這時期抄寫的，這是後話。
一次，周樹人和許壽裳一同去逛滿清駐防旗營廢址，隻見一片焦土，在一處沒有門窗的破屋子裏，有兩個年老的滿族婦女，見了他倆像老鼠見了貓似的，驚懼地連連說沒有什麽，沒有什麽。周樹人講起在礦路學堂讀書時的事，學生騎馬過旗營時受到滿人的欺侮，言下仍有餘恨。
不久，蔡孑民接到命令北上迎接袁世凱。次日，來了一位次長景耀月代理部務。此人好大喜功，隻知擴充自己的勢力，用人惟親。一天，這位次長忽然提出要辦雜誌，將此項任務交給周樹人。他也太不識人，周樹人沒有理睬他。於是，趁蔡孑民不在部裏，他暗中列了一份名單，送請大總統府任命，其中，竟然沒有周樹人的名字。幸好，蔡先生此時回來，趕快把這件事撤銷了，否則將鬧成大笑話。