有了雅虎，有了雅虎40%的股權，阿裏巴巴公司的所有股有了變化，那就是雅虎40%，孫正義的軟銀30%，馬雲和他的團隊30%。但根據協議，馬雲仍然是董事局主席，成員是蔡崇信、孫正義、楊致遠。
2011年，按照馬雲的說法，這一年是阿裏巴巴的本命年。因為，按照中國的曆法，十二年為一個屬相周期。這一年阿裏巴巴幾位股東似乎反目成仇，支付寶的股權轉移引發了一場軒然大波。不僅是股東們，還有互聯網的江湖大佬，輿論界的精英和豪傑，更有國際上知名人士和媒體，形成了一個巨大的輿論爭議漩渦。
理所當然，處於這場漩渦中心的仍然是馬雲。
起因是財經雜誌主編胡舒立的一篇指名道姓的微博，她指責馬雲違背“契約精神”，並說這是市場的基石不可違背。馬雲應聲而辯，於是，從來不缺聲音的互聯網江湖上又是一番波翻浪湧。
事情的起因是馬雲分兩次將支付寶公司賣給了浙江阿裏巴巴公司。也就是說，馬雲將支付寶從合資企業變成了內資企業，脫離了楊致遠和孫正義的控製。而且，這一方案的執行，沒有事前得到孫正義和楊致遠的首肯。他們紛紛指責，這是馬雲的擅自行動。於是，爭執由此而發生。
屬於阿裏巴巴旗下的支付寶公司，按照三方協議，當然屬於雅虎，也屬於軟銀。但支付寶公司的創立和前行卻並不順暢，在馬雲的藍圖中，支付寶是連接所有環節的通道。這條通道必須得到銀行的支持，而銀行是國有的，是有政策規範的。為了和政策能融合，馬雲費了不少的心思，可以說，支付寶如今的地位，是馬雲一手創造的。於是，馬雲在這一爭執中找出的理由似乎理直氣壯，那就是，當政策與股東發生衝突，馬雲隻能選擇政策。
可是，支付寶是一個巨大的利益寶藏。它本來是由孫正義和楊致遠及馬雲的團隊共同享有，此刻卻變成了一家內資公司，也就是說和孫正義、楊致遠無緣了。