閹黨用了四個多月時間，把東林黨的標杆人物六君子從肉體上全部滅掉了，用以殺一儆百。就這，他們還嫌不夠。為了給閹黨惡政搞一套漂亮的包裝，魏忠賢還想從理論上做一番“正名”的工作。
他耿耿於懷的，就是要對萬曆末年以來的“三案”徹底翻案。不把“三案”翻過來，東林黨就永遠是國家的功臣，那麽打擊東林黨，豈不是證明了自己是壞人？
這個工作，其實在天啟四年(1624)十二月就已開始發動。當月，禦史周昌晉上了一道疏，攻擊東林黨在“移宮案”中危言聳聽、以移宮而邀功。這隻是一個試探。因為要翻“三案”，最麻煩的就是翻“移宮案”，這裏麵直接牽扯到天啟本人。如果說當年驅逐李選侍不對，那就等於說天啟不應該親政，而應讓李選侍垂簾聽政。這豈不是否定了天啟皇權的合法性？
可是天啟在政治上基本等於白癡，他的批複，雖然沒有否定“移宮案”的定論，但卻痛罵楊漣、左光鬥等人“向來濁亂朝政”(《明熹宗實錄》)。
這個效果，是周昌晉上疏前就預見到了的。他選的時機，正是楊、左剛剛被驅逐的時候，天啟對兩人的火正大著呢，此疏一上，必然會有這樣的批示下來——小臣有時也可以左右皇上。
既然皇上說了，“移宮案”中的大功臣楊、左是一貫胡來，那麽翻案就大有希望。
於是，到了天啟五年(1625)二月，閹黨正式發動了。由禦史楊維垣出頭，以比較容易翻案的“梃擊案”做為突破口，公開翻案。楊維垣說，當年混進宮裏棒打太子的張差，分明就是個瘋子，跟李選侍無關。這一道疏，天啟倒是心領神會，馬上批示查處。結果，當年主持此案審查、現任刑部侍郎的王之寀立刻被革職為民。
等到“遼案”爆發，對六君子的逮捕令下達後，魏忠賢認為時機已完全成熟，就決定在“三案”問題上發起總攻。四月初十日，給事中霍維華上疏，要求全盤推翻“梃擊”“紅丸”“移宮”三案的結論。