在這期間，軍統局終於以改名的方式保存了下來。
1946年7月1日，國民政府軍事委員會撤銷後的國防部各廳局正式成立。原隸屬於軍委會的調查統計局（軍統局）自然也在撤銷之列。更何況飽受專製獨裁之苦的全國人民一致要求取消特務機關。
但蔣介石為了維護其獨裁統治，仍執意保留特務機關，便於這年10月將軍統局更名為國防部保密局，由已出任國防部第二廳廳長的鄭介民兼局長，原軍統局主任秘書毛人鳳任副局長。
於是，原軍統局東北辦事處也相應改名為保密局東北督導室，原公開掩護單位東北行營督察處改名為東北行轅第二處（軍委會撤銷後各地原軍委會委員長行營改名為國民政府主席行轅）。
在東北的這些日子裏，文強成了國內外關注的東北內戰中國民黨方麵一位活躍人物。以致30年後他獲得特赦時，在戰犯管理部門舉行的告別宴會上，一位負責幹部向他敬酒時還這樣說：
“文強先生，你可能不認識我，我可是早就認識你了。日本投降後我到了東北，那時你在東北可夠活躍的。”
文強當時在東北的“活躍”，除去在接收主權和“反蘇”這一方麵外，另一個重要方麵，是積極從事反共活動。
1946年底至1947年初，因北平發生美軍士兵強奸女大學生沈崇事件，中共在國民黨統區的地下組織以此為導火線，發動了反美、反蔣愛國民主運動；5月，又掀起了“反饑餓”“反內戰”的學生罷課、遊行浪潮，矛頭直指國民黨獨裁政權。
東北國民黨占領區當局為防止學生運動波及，以軍事緊急時期為由，無限製地實行戒嚴、宵禁。盡管如此，東北大學仍然爆發了罷課和遊行示威。東北行轅主任熊式輝、東北保安司令長官杜聿明唯恐東北也鬧成平津、上海等地一樣，一再嚴令要加強鎮壓。