康熙六十一年（1722年）十月，69歲的老皇帝玄燁興致勃勃地到南苑去打獵。他偶感身體不適，即命駕返回京師西郊的皇家苑囿-暢春園休憩，不料病情日漸加劇，延至十一月十三白晚上溘然長逝。當夜，遺體送還紫禁城，安放在乾清官，十四日大鹼。二十日，文武百官奉皇四子胤禛登極，是為雍正。追溢玄燁為仁皇帝，廟號聖祖。
康熙帝是清朝第二個皇帝，君臨天下61年，正是清初的隆盛時期，封建的經濟文化都發展到一個新的頂點。他的逝世和雍正繼承皇位，不但是當時震撼全國的重大事件，而且由此產生了許多傳說和懷疑。
近年來，隨著清史研究的不斷深入，也出現了兩種不同意見。
一種意見認為，康熙是被毒死無疑。中國社會科學院曆史研究所許曾重撰文說，西征之役即將結束時，胤禛返京即位已成定局，胤禛因此采取斷然手段。十一月十二日晚，在嚴密控製暢春園的情況下，隆科多在食品中放入毒藥，致使康熙死去。
另一種意見認為，康熙是久病纏身，因感冒引起其他症狀導致死亡。南開大學曆史係馮爾康的文章指出，康熙身邊警衛森嚴，時有提防，不可能被人暗害。毒死之說是經不住推敲的。
康熙有子35人，女20人。在諸皇子中，胤禛最長，但不是嫡出。嫡出最長者胤礽，康熙十四年被立為皇太子，準備日後繼承大統。清代自太祖以來皆不預立儲位。太祖曾說：“有德者即登大位。”清代之立太子自此開其端。胤礽立為皇太子以後，康熙選派大學士張英、儒臣熊賜履等教之，南巡北狩，都隨駕從行。康熙三十五年，禦駕親征噶爾丹於漠北，皇太子在京留守，得了狂疾。康熙四十七年九月，康熙在布爾哈蘇台行圍時，召集諸大臣宣布廢立，將胤礽幽禁鹹安宮。這是第一次廢太子。這時，太子兄胤是為直郡王，弟胤祉為誠郡王，皇四子胤禛、皇八子胤禩、皇九子胤禟、皇十三子胤祥、皇十四子胤禵都是貝勒，各結黨引類，覬覦儲為。皇太子廢立後，更加植黨暗爭。康熙四十八年三月，康熙念儲位不定，他日必定引起動亂，而廢太子胤礽病情略有好轉，便又立胤礽為皇太子。沒有很久，皇太子狂疾複發，至康熙五十一年不得已仍廢黜禁鋼，從此再也不提建儲的事。但諸皇太子奪嫡之爭益加激烈。