既然女屍已秘密轉移到醫學院存放，狂飆停息，巨浪退去，對博物館和發掘人員來說，下一步要做的，就是盡快清理、處理、保護文物，並將這一發掘成果用簡報的形式公布於眾，以便引起國內外專家共同的參與，對出土文物做進一步的研究和保護。
在所有出土文物中，除女屍之外，最急待處理和保護的當然屬於絲織品。這些埋藏2000多年的絲織品，突然重見天日，從密封的地下那相對恒溫、恒濕、無光、缺氧、無菌的保存環境，突然來到一個溫度濕度變化無常，又直接暴露在光線、空氣、帶菌的環境中，這無疑是給處理和保護工作提出了一項緊迫而艱巨的任務，稍有延緩或處理不當，都會造成不堪想象的後果。20世紀50年代末期，北京昌平明十三陵的定陵，通過考古發掘共出土了80餘匹成捆的絲織品，像這樣大批量的絲織品出土，在中國考古史上是前所未有的。遺憾的是，這些絲織品由於處理、保護不當，全部毀壞無存了。而對於漢代絲織品的探尋，原來隻是在中國西部發現了為數極少的絲綢殘片，且這些殘片的曆史還屬東漢時期，對西漢時期的絲織品尚未發現。馬王堆漢墓竟一次出土如此之多的絲織品，在讓人感到震驚欣喜的同時，也對它的處理和保護格外關注和重視。
盡管這些絲織品的許多品種和朽殘程度，作為絲綢研究專家的王?也是首次遇到，但是他還是針對每件的保存現狀、完殘情況，經過細心揣摩，反複思考，很快製訂出一個清洗、保護、修複的計劃。在他的具體指導下，考古人員對被隨葬食品腐敗和屍體分解物汙染的絲織品，大膽采用了對絲織品無損害，去汙力強，易揮發，又能被水淋洗去掉的化學溶劑，進行脫脂去汙，防止蟲傷黴變。對那些濕時糟朽如泥，幹後則脆如枯葉的部分內棺中的織物，為保存其形製和鮮豔的色彩，則采取傳統的托裱方式保存。而對從槨室中的竹笥內出土的14件完整的袍服，46塊成幅的絹、紗、羅綺、刺繡織物全部展開並采取清除雜物後，經藥物熏蒸滅菌，再放在一個特製的箱匣裏保存，從而避免了印花敷彩織物上礦物顏料的脫落。與此同時，在經過反複試驗後，又對這些表麵完整的絲織品，采用從生絲中提取天然絲膠做材料，噴塗加固的工藝進行保護處理，並獲得了滿意的效果。為對從屍身上剝下的400多件服飾殘片予以保護，王?首創並自製聚乙烯醇縮丁醛絲網，進行加固和修複並獲得成功。當這一切做完之後，為防止受汙染的絲織物在庫房內長黴生蟲，他先采用聚乙烯薄膜袋封存，然後再將袋內的空氣抽出，充滿氮氣，從而製造了一個密閉絕氧的小環境，達到了絲織物可長期保存的目的。