關於第三枚佛指的發現，似乎奇特而神秘，頗令人多讚詞。
第三枚佛指存放在後室秘龕中刨出的那件鐵函中。其實，在鐵函麵世之初，人們便已將注意力集中在了除八重寶函之外的它的身上。
專家們也總感到，這件鐵函為什麽這麽獨特，非要放置於秘龕之內，難道這就是“會昌滅佛”中被法門寺僧眾們偷偷藏匿起來的真正意義上的佛指舍利嗎？
1987年5月9日上午，陝西省文物局文物處處長張廷皓從西安來到扶風，對考古人員和學者們轉達了國家文物局關於開啟鐵函不得損壞函體的通知。從這個通知的傳達中可以看出，扶風縣博物館工作人員的一舉一動，都與北京國家文物保護的最高機關保持著緊密的聯係。
當天下午，韓偉、張廷皓向鳳翔關中工具廠求助，工具廠很快派一位老師傅攜帶工具來到扶風，協助開啟後室秘龕鐵函。
一切準備就緒，鐵函被搬到工作台上，因年代久遠，鐵函周身布滿鏽斑，呈焦茶色。原包裹函體的鮮豔絲綢也早已腐爛朽壞，僅餘焦炭狀的一少部分粘連於函頂。通過放大鏡仔細探視，發現絲綢為羅線織成，其間有金色折枝花及雲紋。王?、王亞蓉、曹緯等專家，用關中工具廠的刀具小心地清除了函縫中的鐵鏽。因正麵的函縫已鏽實，無法開啟函蓋，考古人員隻好再次仔細分析X光透視片。為了嚴格而科學地探清這隻鐵函中的隱情，事先考古專家們已在扶風縣醫院透視室，對函內的一切進行了透視。函內顯然有“異狀物”，但模糊不清，很難進一步確定具體內容。連續兩天，專家們反複對這異狀物“會診”，但總是不得其真正要領。今天的研究仍然沒有得到一個滿意的解釋。
王?與王亞蓉為鐵函除鏽
大家決定不再紙上談兵，隻要打開寶函上的子母扣，取出函中物，一切不都真相大白了嗎？於是，曹緯用磨製鋒利的鋼式刀具，鑿掉了子母扣中的鐵臂，隨著函蓋輕微地顫動，封閉嚴實的鏽斑全部脫落，函蓋毫無損壞地被輕輕打開，裏麵露出了兩枚隨球[1]和幾片腐爛變質的絲綢。當這一切做完之後，已是5月10日的淩晨了。