對李世民來說，武德舊臣治國理政的水平確實很一般，他是有偉大理想的皇帝，也想幹出一番事業，自己牛不算真的牛，他需要一批能臣幹將，能夠在關鍵時刻為他出謀劃策。因此，貞觀一朝的權力還需要繼續洗牌。
貞觀元年（627）八月十九日，侍中高士廉被人舉報隱瞞信息，李世民將他罷免。九月十二日，中書令宇文士及被降職為殿中監，禦史大夫杜淹參與朝政。
貞觀二年（628）正月，某位大臣給李世民遞了個秘密奏折，狀告長孫無忌權力太大，又是皇帝的親戚，很容易形成外戚專政的局麵。
客觀地說，朝臣們也不是故意挑事兒。唐朝立國之初，製度還不完善，朝廷大事由皇帝和幾個開國功臣說了算。就拿中央政府的編製來說，尚書省除了左右尚書仆射、六部尚書之外，下麵全是跑腿的屬下。至於六部侍郎、侍中，截至目前，朝廷並沒有設置這樣的崗位，因此宰相集權的現象非常嚴重！
不過，李世民非常豁達，他將告狀的奏折拿給長孫無忌，安慰道：“小舅子啊，朕對你沒有絲毫的懷疑，朕擔心和你之間產生隔閡，這才把奏折給你看！”
不僅如此，李世民以為朝臣在搞政治鬥爭，因此在開朝會的時候公開表態：“朕最信任長孫無忌了，你們這些朝臣就不要瞎吵吵了！”
長孫無忌是個聰明人，李世民越是這樣，他越覺得不安。事後，長孫無忌遞交了辭職書，還讓長孫皇後勸說李世民，這才從尚書右仆射的位置退了下來。
貞觀三年（629）二月，也就是李淵交出太極宮的控製權，裴寂被李世民打壓之後，秦王府的勢力開始走向了前台。李世民下詔：任命房玄齡為尚書左仆射，杜如晦為尚書右仆射，尚書右丞魏征為秘書監，參與朝政。
房玄齡和杜如晦就不用多說了，魏征的戲份必須給足了。