除了參與蛋白質合成，多功能細胞器內質網還能作為細胞內的鈣庫接收並傳遞信號，同時負責脂質的合成。在細胞內，脂肪以微小的單液滴形式生成於內質網表麵，這一過程稱為脂肪生成（lipogenesis）。雖然我們所熟悉的脂肪，如牛排邊緣及我們腰身周圍的脂肪，看起來似乎是均勻的固體腫塊，但事實上它們均以被膜脂肪滴的形式儲存於脂肪細胞中（如圖3d所示）。如果持續地攝入營養，脂肪細胞中便會有越來越多的脂滴積累。這些脂滴與鄰近的脂滴相融合，變得越來越大並占據了細胞的絕大部分體積，最終使得細胞達到其“正常”體積的100倍以上。因此，肥胖是脂肪細胞內脂滴持續積聚所引起的能量平衡紊亂的結果。在這一點上，我們可能會懊惱內質網如此優秀的脂質合成效率。除了提供脂肪儲存，光麵內質網中還存在一些特殊的酶類以分解脂肪，這一過程被稱為細胞內脂質水解或脂解。因此，影響體重的一個主要因素便是內質網中脂質合成與分解之間的平衡。眾所周知，超重將對健康產生重大影響。但令人遺憾的是，細胞水平的脂肪代謝卻受到了相對較少的關注，脂滴也僅僅被認為是簡單的脂肪儲存庫。新近研究表明，脂滴其實是一種特殊的細胞器而非“脂肪塊”。所有的真核細胞都具有合成脂質的能力，而這些脂質還可以進一步形成天然油脂產物，如來自植物細胞的菜籽油、橄欖油，以及來自動物細胞的乳脂、羊毛脂與豬油。脂質分子在內質網表麵聚集，隨後形成了單個液滴（由一層脂質單層膜包裹著），並保持在富含脂質合成酶的區域處。線粒體與脂質合成密切相關，可為脂質合成提供能量。事實上，負責脂質合成的線粒體由一組膜蛋白連接至內質網表麵。隨著越來越多的脂質積聚，單個脂滴通過膜融合與相鄰脂滴相融，進而形成更大的脂滴（如圖3d所示）。與此過程相反的是，在脂肪分解過程中，大的脂滴被分解成小的脂滴，來自光麵內質網的酶可將脂質分子進行分解，從而縮減了脂滴的大小。