司馬倫為了收買人心,注重選擇有良好名聲的士人充實朝廷。他任命前平陽郡(今山西臨汾市)守李重、滎陽郡(今河南滎陽市)太守荀組(荀勖的兒子)擔任左、右長史;任命王堪、劉謨擔任左、右司馬;尚書郎束皙曾參與整理古書《竹書紀年》,因此讓他擔任記室(記錄官)之職;任命荀崧(荀彧的五世孫)、陸機擔任參軍。這些人中,李重知道司馬倫有篡位野心,想稱病不去就職,但司馬倫不斷威逼,催他上路,李重憂心忡忡,竟真的生病了。他拄著拐杖前去領命,但不久之後就病逝了。
當初賈南風廢黜太子時,司馬倫本來準備立惠帝司馬衷的七弟淮南王司馬允為皇太弟,作為帝位的繼承人,但群臣意見不一,最終也沒有落實。司馬倫掌權後,任命司馬允為驃騎將軍、開府儀同三司兼中護軍。
司馬倫認為故太子司馬遹的二兒子司馬臧(年四歲)年齡小容易控製,於是在永康元年(300)五月九日,讓惠帝下詔立臨海王司馬臧為皇太孫。又命司馬遹的太子妃王惠風返回東宮,撫養司馬臧。太子宮原有的臣僚全部轉為太孫的官屬,相國司馬倫兼任太孫太傅。
淮南王司馬允擔任中護軍一職,性格沉穩剛毅,皇宮禁衛官兵都很敬重他,從心底裏聽命於他。司馬允知道司馬倫和孫秀懷有異心,在被升官後,就開始稱病不上朝,並暗中豢養死士,謀劃除掉司馬倫等人。司馬倫、孫秀對司馬允也比較忌憚,八月,借口擢升司馬允為太尉,奪取了他的兵權。司馬允繼續稱病不去接受任命,司馬倫便派禦史劉機逼迫司馬允交出印鑒,還逮捕了司馬允的手下,上書彈劾司馬允違抗任職詔令。
司馬允仔細檢查了詔書,發現竟然是孫秀的筆跡,勃然大怒,馬上扣押了劉機,要殺死他,但劉機不愧名字裏有個“機”字,很機靈地逃脫了,司馬允隻殺死了劉機的兩個隨行令史。