七月十三日文天祥到達南劍州。他建立同督府，廣發朝廷詔書，招兵買馬，廣納賢士，聚兵集財。汀州百姓踴躍參軍，士紳獻金獻糧。他派人去贛南粵北召集舊部，很快又有了將士一萬餘人，成了氣候。他開始東征西討，抗擊元軍，打擊地方土匪，形成很大影響。這年十月，朝廷命文天祥移軍汀州，由王積翁接替他鎮守南劍州。
文天祥於十一月到達汀州，即派人去福安稟報朝廷。那小校回來回複文天祥說：“報告丞相，末將齎文去到福安，半途上發現已經是元軍勢力範圍。我向路人一打聽，才知道朝廷已經離開福安，從海上走了。”
“那麽南劍州呢？”文天祥著急地問。
“末將打聽得的情況是，隻在前幾日，王積翁大人見元軍南下，勢不可擋，便棄城逃跑。他十四日回到福安，向朝廷報告，引起朝廷文武大臣恐慌，遂於次日全部登舟出海而去，不知所向。”
文天祥大為震驚：“啊，我知道南劍州會丟的。我們離開南劍州時將防務交與王積翁，我就知道他不可靠。如果是我在南劍州，與元軍好歹有一拚，不會讓朝廷在福安坐不住。”停了一會後他問自己，“朝廷會去向何方？”
文天祥自言自語：“往北方去是不可能的，他們是從溫州遷移來的。隻有往南方，去泉州，或是廈門。一定要千方百計找到朝廷，我們才有依靠。”
小校的稟報讓文天祥心涼半截。他自建立同督府以來，軍餉糧草概由自籌，沒有依靠朝廷。他事事稟報朝廷，領受朝廷指諭命令，可是現在朝廷流亡海上，與他斷了聯係，他連心理上的支撐也失去了。此後他隻是憑內心一股正氣，繼續孤軍奮戰。
文天祥在汀州時，文璧與他聯係上了。文璧從朝廷的邸報中了解到文天祥在汀州，就派人與他聯係。文天祥立即回信，商量讓文璧把家眷送來。文璧鎮守惠州，不能離開，托文璋送去。文璋於十二月帶了母親曾氏、文天祥的妻妾子女還有顧玉紓從惠州出發了。