在明確了問題境況，解答了相關的理論難題，提供了可行的研究方法後，我們緊接著要問的是，人類科學認知的結構到底呈現出一種什麽樣態？有沒有一種經驗或具象的描述能夠指稱它？或者說它能夠通過某種模型表征出來嗎？為了研究的需要，我們確實需要采取一種策略。這種策略就是一種類比性的思考和基於模型化的論證。曆史的經驗表明，研究方法和思想觀念上的轉換與變革，經常是與大膽的想象、類比、隱喻的思維方式聯係在一起的。在這種思維方式中，研究者的思想桎梏最容易被突破，研究的對象最容易在廣泛的領域裏暴露出內在的相互關係，並向人們展現出世界係統的統一性、相似性乃至“生命性”。我認為，這個類比性的對象和模型就是人類自身的大腦。在本章中，我從人類大腦的生理和神經組織的結構與功能出發，通過適當的簡化與歸納處理（包括依據國內外最新的腦科學、認知神經科學、神經心理學等提供的材料，對傳統關於大腦兩半球結構與功能的部分觀點進行修正等），提供一個簡化了的“樣本模型”，然後再將這個“樣本模型”與“目標模型”（曆史上實際發生了的人類科學認知活動）進行比較，以期通過前者來類比性地說明後者。最終得到一個解釋人類科學認知結構的“類腦模型”。