宋代是中國古代的醫藥學進入了全麵發展的新階段，在醫學理論、各科的臨床診斷以及藥方等各方麵都有長足的發展。
首先在醫藥書籍的編撰方麵。宋朝政府十分重視醫學書籍編纂工作，因為醫學水平的高低不僅關係到一個時代的文明程度如何，也反映了人們在抗拒災害方麵的能力。所以，從宋立國之初就對醫藥書籍的修訂工作相當重視。宋代第一部本草是在太祖開寶六年至開寶七年（973—974年）由劉翰、馬誌等人奉詔依唐代《新修本草》和五代《蜀本草》為據修成的《開寶本草》。此書共21卷，所記載藥物達983種。第二部本草是仁宗朝嘉祐二年（1057年）由蘇頌等人奉敕所修的《嘉祐本草》，是書共20卷，所載藥物達1082種。隨後不久，宋帝又令各州郡把該地所產的藥物繪成圖送到汴京，最後由蘇頌加以整理編成了《圖經本草》。
《重修政和經史證類備用本草》（北宋）
到了北宋中後期，四川成都一醫人唐慎微在總結前人成果的基礎上又編成了一本本草，即《經史證類備急本草》，簡稱《證類本草》。該書內容豐富，有31卷，60多萬字，收錄藥物1700多種。本書主要特點在於：在序例中闡述了百病主治藥物，服藥食忌例以及藥物的畏、惡、須、使等方法，使人們對曆代本草的源流和藥物的配比禁忌有了大致的了解。此外是書中除收錄宋以前諸家本草的內容外，又采用曆代單方，並驗之經史百家中有關藥物。此書不是官修，乃為私修，比前代本草有進一步的發展，故而明代醫學家李時珍對此評價頗高，認為“使諸家本草及各藥單方，垂之千古，不致淪沒者，皆其功也”。
《小兒藥證真訣》
錢乙編著（北宋）
到了北宋末年，寇宗奭又在此基礎上撰成《本草衍義》一書，此書所載藥物雖隻有472種，但發明頗多。不僅推翻了前人的性味說，創立氣味說，而且還認為治病用藥，必須依病人的虛、實、老、少，病情的長與短以及藥物毒性的大小等，酌情使用，不能拘泥於成法，這是很合乎科學道理的。