人工流產由於幹擾了婦女正常的生理過程，又是一種手術操作，帶有一定的風險性，且手術後可能遺留一些近期或遠期並發症。人流次數越多，間隔越短，發生並發症和後遺症的可能性越大，例如出血、感染、月經紊亂、子宮內膜異位症、不孕症等。
人工流產術後子宮內膜需要一個修複過程，短時間內體內激素水平可能會暫時紊亂，由於子宮內環境的不穩定，再次懷孕則容易影響胚胎的生長而導致流產等，不利於妊娠的順利進行，也給母體健康帶來危害；若一旦妊娠，則由於子宮內膜修複不良，可能會發生胚胎著床後胎盤附著異常，如低置胎盤、前置胎盤，成為產前大出血的主要原因之一，還可能造成產時的胎盤胎膜粘連、殘留，致產時、產後大出血而危害產婦健康。所以，流產以後至少應休息3個月，最好在半年以後再考慮妊娠。