皇太極為了徹底困死這支明朝的精銳部隊，又下令，各旗在各自的防地環城挖溝。溝，深1丈，寬1丈。溝外，再築1丈左右高的牆，牆上修築垛口。在牆內，距牆5丈左右的地方，又挖一道深7尺5寸、寬5尺的溝，溝上鋪上秫秸，上麵蓋上土。
皇太極的工作，就是在大淩河城南的山岡上，監視城內的變化。
後金軍在城外的行動，祖大壽掌握得很清楚。大淩河城剛剛築畢，城內各種防務措施並沒有落實到位，軍用物資貯備不足。皇太極選擇與祖大壽打消耗戰，就是抓住了大淩河城的命脈。
祖大壽認為，等後金軍在城外挖好壕溝之後，大淩河城就真的變成一座孤城，裏麵的人出不去，外麵的人進不來。時間拖得越久，城內士兵的戰鬥力就越弱，連吃飯都會成為無法解決的問題。皇太極不費一槍一彈，就會把這支能征慣戰的軍隊活活困死。
明軍最好的選擇，也是唯一的選擇，就是在後金軍修好防禦工事之前衝出去，回到錦州。
於是，祖大壽選擇離錦州最近的南城突圍，與莽古爾泰率領的正藍旗士兵，展開殊死搏鬥。
皇太極已經下了死令，明軍在誰的陣地突圍，誰就要為此付出高昂的代價；明軍為了求生，也是死戰。兩支都輸不起的軍隊，在大淩河城南，殺得屍積如山，血流成河。
祖大壽多次組織士兵突圍，均未成功，不得不退回城內。正藍旗為了達到不放走一人的作戰要求，也付出了極大的傷亡代價，減員嚴重。
8月12日，明軍又從南城突圍。兩藍旗將士拚死截殺，把明軍趕回城去。
兩藍旗將士殺得興起，直衝城下。沒想到，城上炮火齊發，打得因勝利而得意忘形的兩藍旗軍措手不及。尤其正藍旗兵，傷亡更重。
莽古爾泰受不了了。後金與明政府開戰，兵圍大淩河城，乃八旗共同之事，現在卻成了正藍旗與明軍單獨作戰了。正藍旗的將士，死的死，傷的傷，而其他旗人毫發未損，這也太不公平了。