李恪將李言還有於家、元家兩家收到自己麾下之後他便將狄知遜具體負責整合太原各世家的勢力，讓王中長帶領鷹衛從旁協助，必要的時候可以動用武力。而他自己和蘇定方、劉仁軌兩人將精力放在了軍隊的訓練上，而許敬宗自然跟隨在李恪身邊，負責軍情的收集和匯總的同時還兼職著糧草的事務。
至於，柴哲威和李宗還有尉遲俊三人，李恪已經通過都督府給他征兆了三千新兵，命令經驗豐富的陳其協助訓練。而李恪下令讓侯虎尋找的鴉片的種子已經帶回了太原，吩咐人在城外選擇了一塊地方建立了溫室大棚，開始培育鴉片的種子，目的是以備來年能夠在太原府地域大麵積種植。
同時，他還是將長安為他做證的郎中聖德言召到了太原，對外說的作為都督府的禦用大夫，但李恪實際的想法的想利用他醫學專長為自己提煉鴉片，使得自己能夠獲得純度更好的白粉。
時間過的很快，轉眼間貞觀二年已經結束，迎來了新的一年，既貞觀三年，在貞觀三年發生的第一件事情就是，沙門法雅因妖言惑眾被處死。司空裴寂曾聞其言而沒有上奏，貞觀三年正月，裴寂被免官，遣回故鄉蒲州。裴寂請求留在長安，李世民不許，並指責他功不補過。武德年間身居相位而朝政不清，都是他的責任，裴寂返回故鄉蒲州後不久，又因狂夫信行妄言裴寂有天命，裴寂又沒報告，應當被處以死刑，但李世民隻將他流放到靜州（今廣西昭平縣）。後來山羌起事，有人要劫持裴寂為主。裴寂帶領家僮攻敗山羌。李世民顧念裴寂曾經幫助高祖起事，便下令征他入朝，而裴寂召還即卒。
第二件事情就是，貞觀三年正月，長孫無忌請罷右仆射。但是長孫無忌與李世民為布衣之交，即在李世民未起兵之前已與他關係很好，又加上長孫無忌是長孫皇後之兄，並且在玄武門事變中起過重要作用，所以李世民對他非常信任，為其它大臣所不及，在他沒有被任命為尚書仆射時就多次想用他為宰相，現在已經身為尚書右仆射長孫後請求罷右仆射，李世民怎麽能答應呢。但是，在經過長孫無忌的多次請求和長孫皇後的多番勸諫，李世民終於還是免除長孫無忌的右仆射，而授以他司空的職位，開府儀同三司，任能參與政事。如此一來，長孫無忌不但沒有被免職，反而權利更勝從前，這是任何人都沒有預料到的結果。而因為長孫無忌尚書右仆射被空出，蕭禹又免職在家，貞觀三年三月，李世民以房玄齡為左仆射，杜如晦為右仆射，均參與朝政。而房玄齡善謀略，杜如晦善決斷，李世民的這次任命讓兩人在唐朝曆史上留下了名相，“房謀杜斷”的美譽。