原道寧把聖戰軍整編的最終方案送到鳳九淵的手頭後，他又作了一些小幅度的修改。畢竟自己現在還能控製局勢，如果不趁著這時候多作點事，等到權力不在自己手裏後，再想改變什麽就難囉。
對整編方案修改的第一點是：軍事委員會共設立委員13名，其中國會3個名額，鳳舞1個名額，剩下9個名額全由軍隊高級將領擔任。軍委不常設立，隻有遇到國家危機或是有戰事時才組建，平時由軍委下轄的參謀聯席會議負責對軍隊的管理。參聯會責任人為鳳舞，其他有4-6名軍隊高將擔任參聯委員，日常工作鳳舞不兼管，由參聯會副主席和參聯委員會主持。軍委一旦設立，將受到國會全程監督，國會沒有權力幹預軍委的工作。危機解除或戰爭結束，軍委必須在3-6個月內解散。如果不解散，國會有權凍結軍委申請的所有預算劃撥，鳳舞也將凍結所有命令的執行。
在這一點的修改之上，鳳九淵可謂是良苦用心。他先是和在建國籌備委員會裏擔任自己代表的楊善談了整整一天一夜，又綜合了有史以來各種的軍事製度作為考證，這才形成了最終的修改意見。
他的修改標準是首先保證國家的安全性，其次才是軍隊的獨立性，其他需要考量的是國會必須對軍隊起到足夠的監督和製衡，但又不至於影響到軍隊的日常工作。
說實話，站在他本人的角度，確實討厭政治幹涉軍事，以政治為目的的各種戰爭。都說戰爭是政治的延伸，他是不同意這一點的。現在人類已經統一，科拉米亞不會跟人類發生碰撞，除非是人類主動發起挑釁。所以，合眾國政治的所有目的就是管理好國家和服務好人民，舍此之外，便是黨派團體之間的鬥爭了。在鳳九淵的構想裏，內部的政爭怎麽搞都可以，縱橫連合，傾軋暗殺都行，但隻要不動用軍隊，作為國家主體的人民就不會受到根本性的傷害，隻要守住了這條底線，政爭怎麽鬧都在容忍的範圍之內的。