打倒了曉的入侵後，並不意味著事情已經完結了，反而有更多的麻煩事正等著木葉。
村子的重建，警備係統的激活，五代目不能執行職責等等一係列的問題，比起打倒佩恩，要麻煩和繁瑣一百倍不止。不過好在這一次佩恩因為要防備花褚，並沒有將木葉完全摧毀，但也不容樂觀，整個木葉也隻有火影大樓那半條街為界往後的建築還保存完好，其中包括了木葉學校和醫院設施。
“昏迷”的綱手住進了醫院，被最高級別的護衛保護起來，與此同時，暫時接替綱手指揮的花褚下令，除了自來也，花褚，靜音之外，任何人都不得不經申請接近五代目火影。
除此之外，花褚還承擔了更多的工作，比如負責木葉的重建，警戒係統的激活。自己讓綱手避開，但不意味著花褚就輕鬆了。在綱手大人“昏迷”前，曾下令由花褚暫時接過工作，而且是自來也嘴裏說出來，沒有任何人懷疑，可見花褚在木葉的名望和地位已經不容置疑，隻是花褚叫苦連天。
把指揮中心設在了木葉醫院，花褚就沒日沒夜的忙起來，隻是這段時間沒什麽好消息。
由於木葉遭到破壞，火之國的各種強盜土匪也變得活躍起來，而更多的不知底細的流浪忍者也開始湧向火之國，給火之國的安全隱患增加了不少危機。
好在這些年，花褚也協助了綱手處理過不少事，遇到這些麻煩也不煩，而是一一安排完畢。
重建的總負責人交給了大和，因為他是目前唯一的會使用木遁的人，警備係統的工作交給了卡卡西這位前暗部總隊長，同時命令在目前空曠的地方大量紮起帳篷，由村子給居民提供救助，同時讓人組織居民進行重建工作，將木葉重建劃分了三十三個區，按照五期依次重建。
於此同時，花褚立即給宇智波止水寫信，讓他立即利用手上的物力人力財力，招募了一大批信得過的能工巧匠以及大批的應急物質迅速送往木葉，同時以黑電惡魔的名義在火之國全境發出通告。在木葉穩定下來的這段時間內，任何敢鬧事的團隊組織，以後黑電惡魔花褚會一一上門拜訪，很快花褚的惡名就顯現出了效果。發出通告後的第四天，各處回報基本安穩下來。