雖然昭宗身旁的人已經全部換成了自己的人，但朱溫還是不放心，特別是逢朱溫將昭宗遷離工安之後，李茂貞、李克用、、王建、楊行密、劉仁恭等藩鎮紛紛加以聲討，朱溫見此情景更加害怕昭宗會與他們內外相聯，便又想了一個歹毒異常的辦法來解決這個問題。那就是殺死昭宗，另立新帝。在這一年的閏四月，昭宗終於來到了洛陽，朱溫便以部將朱友恭、氏叔琮分別為左右龍武統軍，負現宿衛，並且其他的重要位置也換上了自己的人。五月，昭宗在崇勳殿衣朱溫及百官，等宴會完畢，又召朱溫入便殿繼續飲宴。可是朱溫接到詔令這後左思右想不敢入內，害怕昭宗會在裏麵埋伏人害他。昭宗見朱溫不進來，便又說道：“既然朱溫不來，那可令敬翔進殿。”朱溫一聽此言，心中暗恨，因為敬翔乃是他身邊最生要的人物，他怎麽可能會讓敬翔去以身試險，便把敬翔往旁邊一推，低聲叫他出殿，然後高聲說道：“陛下，敬翔現在也已經醉了，也不能入殿侍奉陛下。”昭宗見此隻得作罷。
不久之後朱溫又回到了汴州，給在洛陽城的朱友恭與氏叔琮發去了密令，令他們二人秘密殺掉昭宗，再立年公十三歲的輝王為帝。在這一年的八月，朱友恭等果真按照朱溫所說的秘密殺死了昭宗，又假稱皇太後手令，擁立輝王登基為帝。朱溫在汴州聽到昭宗遇害的消息之後，還裝作一副很吃驚的樣子，並且伏地痛哭，哭得是死去活來，這一次他周圍的將領都是心知肚明這件事明明就是朱溫派人做的，但知道歸知道，但假戲還得真做呀，也都跟著一起痛哭，勸說朱溫不要太過傷心。在十月十三日，朱溫趕到了洛陽，又在昭宗的靈柩前痛哭不已，朝見完靈柩之後，還一本正經的去朝見新帝。為了殺人滅口，毀滅自己的罪證，朱溫借故