在紹興元年二月，宰相範宗尹被罷職，朝中相位空缺。秦檜見了之後異常眼饞，就到到處揚言：“我有兩條妙計，可以聳動天下。”有人問他何以不言？秦檜故作神秘的說道：“今無相，不可行也。”到了這一年的八月，趙構果然拜秦檜為右仆射、中書門下平章事兼樞密院事。秦檜終於當上了宰相。其實秦檜還大樹同黨，排斥異己以固相權。秦檜一當上宰相，就對他的同黨大加封官委職，隨行人員王安道、馮由儀等人均封侍郎以上職，就連為他操櫓劃船的水手孫靖也當上了承郡郎。當時與秦檜同掌相權的還有呂頤浩，為了獨攬大權，秦檜反比例同黨上書趙構，要求與呂頤浩各掌其職，從而氫呂頤浩排擠出朝廷，隻得去鎮江另建一都督府。因為秦檜在朝廷任職時間不長，根基還不穩，行為又太過火，太露骨，招致人人側目，群起而攻之，紛紛指斥秦檜是奸相，要求將其罷免。而宋高宗本人見秦檜任相以來毫無作為，就認為他隻會說大話，無行動。就對大臣們說道：“秦檜曾說南自南，北自北，朕是北人，怎麽能歸北？又說為相數月，可聳動天下，今毫無動靜，不可信也？”話中表示出了對秦檜已經失去信心，就罷免了秦檜，使之出任文華殿學士、提舉江州太平觀。而秦檜之黨也隨著秦檜的被罷免被逐出了朝廷。
宋高宗紹興五年，金主撻賴派人來南宋，與宋人正式議和。從紹興五年至七年，南宋是派右相張浚與金人談判，可是效果不大。張浚是武將，屬主戰派，他的工作使趙構很不滿意，張浚無奈之下隻得離開相位去軍隊指揮打仗。張浚臨走之時，趙構問道：“誰人可以代卿為相呢？”張浚不答。趙構想了一會兒又問道：“秦檜如何？”張浚歎了一口氣說道：“陛下，此人心術不正，不可為相。”但為議和早日成功，趙構根本就沒