隨著對宋戰爭的展開，剛有起色的財政又陷入了困境，阿合馬不得不想新招來應付眼前的饑荒，以求繼續得到忽必烈的寵信，他想到兩招，其一濫發紙幣，二增加稅收。忽必烈時發行的紙鈔叫做中統元定交鈔，簡稱寶鈔。它以銀為本，每兩貫鈔折銀一兩，開始發行時信譽很好，可以隨時持往官庫存兌換銀兩，幣值也很穩定，民間很看重寶鈔，甚至於視鈔甚於重銀。阿合馬也重視寶鈔，因為他已經從寶鈔當中看到滾滾而來的財源。阿合馬隨心所欲地增加寶鈔的發行量。從原來每年的十萬錠增加到數十乃至最高達到一百九十餘萬。與此同時，他又把各地庫中的鈔本金銀悄悄運回了京城，借皇定官府揮霍，一時間，寶鈔一下子變成了一文不值的廢紙，造成了物價飛漲，一石寶鈔竟然換不了一鬥小米，百姓們無不怨聲載道，每有一個不憎恨阿合馬的，簡直是憎恨到了極點。他的第二個增加收入的方法就是增加賦稅，這是封建政府斂財的一個常用手段，隻不過在阿合馬手中玩出了新花樣。糧、鹽茶等稅不說，他還增加了醋稅，甚至老百姓的家裏死了人，也要交一筆莫名其妙的喪葬稅，至於其他阿合馬下令增加的稅種更是多如牛毛，數也數不過來。經過阿合馬一番的調整，元朝的財政又有了較大的恢複，由此，忽必烈更加的寄信阿合馬，把他視為自己最大的功臣，對阿合馬也寬容到了極點，隻要沒有冒犯自己的尊嚴，阿合馬無論做了什麽壞事，他是從來都不過問的，實在有些看不過眼的，也就隻是打打板子也就是了，但阿合馬的平章政事一職，卻從來沒有給他動過。
由於忽必烈給他的實在是太多了，他希望別人也給予他更多的東西，例如尊重啥的，討好他。然而事情並沒有像他想像的那樣好，有許我的人都視他為跳梁