嘉靖三十四年，大明苦於南倭北虜之際，朝鮮也遇到了大麻煩，一支屬於汪直麾下倭寇登陸朝鮮，**朝鮮邊防海防，肆虐數月，幸而人數不多，被朝鮮人用計打退，是為“乙卯倭變”。
朝鮮的地方軍製原本采取鎮管製，這種製度類似於中國的節度使，把軍權下放到地方諸道，歸於各巡查使，但自從乙卯倭變之後，李朝政府對道府專權心存忌憚，便把地方軍隊的指揮權從道府抽離了。
他們另外搞了一條獨立係統，兵權被打散，歸屬於本道兵水使，再往上一級到助防將，再到防禦使、巡邊使、都元帥，層層統轄，諸道均不得幹涉，也不能指揮。
說白了，其實就是在朝鮮全國範圍內，行政和軍隊分成了兩條管理線，彼此平行，誰都不必聽誰的，如果有什麽敵情，道府可以跟軍區司令商量，兩個人關係好的話，可以配合行動，但若是軍區司令不搭理道府文官，那文官也一點轍都沒有。
這種軍政分離的製度相當先進，切實有效，把軍權歸於朝廷，地方政府文官不得幹涉，而軍隊總帥都元帥是由朝鮮王親自任命，則軍權歸於朝鮮王，文臣不得幹涉。
因此大戰初起之時，李玨、樸泓之類的將領所以敢一撤千裏，無視宋象賢、樸晉等府使的約束，正是因為這種軍政互不統屬的體現。
蕭如薰聽柳成龍說起此事，感覺相當有興趣，再讓柳成龍詳細說說，柳成龍就苦笑著說，這辦法是好，但是一旦遇到這種極其強力的敵人的外侵，弊端就出來了。
地方軍政統屬不一，有的是武將抵抗文官府使逃了，有的則是文官府使抵抗武將卻逃了，雙方若不配合，這一府之地就無法集合全力對抗外敵，雖然保證王室權力，可是對於國家而言未免不便。
蕭如薰心裏就尋思開了，其實最開始，大明朝也是這樣做的，衛所製和五軍都督府成為一條軍事管理線和文官係統互不幹涉，但是土木堡之變前後，衛所製衰落，明軍武將的素質和士兵的素質大大降低，已經完全無法適應國家的需要了。