蕭摩訶，字元胤，出自蘭陵（今山東峴縣），最早的祖先可以上溯漢初名相蕭何，五胡亂華時蕭氏南渡，僑居南方，蕭摩訶本人則以勇猛稱著。摩訶二字出自佛經，梵語，意思是大。
蕭摩訶的祖父蕭靚是南梁時的右將軍，父親蕭諒做到了梁朝的郡丞，至於蕭摩訶本人，在三十多年前的南梁時代就已經粉墨登場了。
早年的蕭摩訶曾經多次斬將奪旗，單騎衝鋒陷陣，號稱有關羽張飛之勇，更是在與北齊軍的大戰中，一人獨斬十餘名北齊軍中的胡人猛將，殺得北齊軍人人喪膽，從此威名天下皆知。
開皇元年（580年）的時候，楊堅登基，以隋代周，從此開始一心準備南征滅陳，陳宣帝大駭，命蕭摩訶為驃騎大將軍，率鐵騎沿江防範。
到了開皇二年（581年）年的正月，陳宣帝因焦慮和疾病而過世，當時的太子是陳叔寶，但他的弟弟始興王陳叔陵也在場，趁著陳叔寶哭泣不備之時，拔出一把銼藥刀砍到了陳叔寶的脖子，又刺傷了陳叔寶的生母柳皇後，企圖奪位。
結果陳叔寶傷重未死，逃出了大殿，回東宮據守，而陳叔陵也一不做二不休，發動了自己的王府衛隊，準備在建康城內與太子大戰。
當時陳朝的正規軍全在江岸一帶布防，城內空虛，百官也不知道應該支持哪方，都持觀望態度，以至於無人去討伐陳叔陵。
陳叔寶回東宮後，緩過了神來，聽了左右的諫言，派人急召蕭摩訶，於是蕭摩訶率了數百步騎緊急回城，入東宮護衛陳叔寶。
陳叔陵沒有辦法，隻能跑路，最後蕭摩訶率兵緊追不舍，將其斬殺。
由於蕭摩訶在最關鍵的時候支持了陳叔寶，所以這位陳後主即位後，對蕭摩訶也是厚加賞賜，封他為車騎大將軍，綏建郡公，食邑三千戶，特賜蕭摩訶開黃閣，位同三公，可以乘車上殿的待遇，並以其女為皇太子妃，還把陳叔陵的財產金帛全賞給了蕭摩訶，一時間恩寵無以複加。