閩粵聯合軍政府成立的同時，在閩粵交界處的汀江一帶，何宗蓮的第三軍遭到粵軍第一師和第二師的前後夾擊。
丹竹山炮戰進入第三天時，隨著清軍最後一門火炮也被炸毀後，清軍已經失去了戰場主動權。
粵軍前後夾擊，第一師和第二師的師屬重炮團對清軍陣地進行全麵炮火覆蓋，給清軍造成嚴重傷亡。
但最致命的是粵軍的馬克沁重機槍，這東西用來進攻不是很靈活，但是用於堅守陣地卻是得才所用。
清軍全力衝鋒，沒有火炮支援無法越過粵軍的重機槍陣地，隻能留下一片片屍體。
戰至15日，粵軍在強大炮團的掩護下，步步緊逼，將清軍包圍在水口庵附近的幾座小山上。
此時清軍第三軍禁衛軍死傷過半，第一鎮折損三分之一，何宗蓮即沒辦法通過汀江，又無法殺回永定，被困在山上孤立無援。
何宗蓮不知道外麵情況，以為可以等到援軍，但是被困了十多天後，清軍糧食彈藥紛紛告急，勢不能支。
1第三軍剩下不足五千人盡數投降。
至此，清廷失去了賴以維係的旗人軍隊禁衛軍和第一鎮，製衡漢人的力量急劇減弱。
清廷方麵有戰鬥力的不外乎禁衛軍和北洋六鎮新軍，如今禁衛軍、第一鎮被滅，第六鎮嘩變，能夠戰鬥的隻有袁世凱控製二、三、四、五四鎮新軍。
何宗蓮的第三軍全軍覆沒的消息迅速傳遍全國，頓時鼓舞了全國人民的革命熱情。
5月5日，廣東、武昌起義爆發，昆明革命黨人便秘密開會決定奮起響應，推舉蔡鍔為臨時總司令，起義時間定在6月30日午夜12時。當時清政府已經是風聲鶴唳，草木皆兵。總督李經羲在總督署內外修築工事，並下令逮捕革命黨人。
第七十四標因秘密搬運子彈，泄露了消息，不得不提發動革命。雲南講武學堂校長李根源等率部從北教場攻昆明北門，城內講武堂學生打開城門，迎接革命軍，兩軍匯合，進攻軍械局。李經羲指揮巡防營占領五華山，依靠地利同革命軍作戰，戰鬥隧形成僵局。