揚州段江域能供大軍渡江的就是瓜洲渡口，除此渡口外，沿江大部分區域都是爛泥灘塗，大船近不得，小船能近卻無法將輜重拉運上岸。故曆來北軍南下渡江，或南軍渡江北伐，要麽在采石磯，要麽在瓜洲，間或浦口。
因此，陸四同樣將決戰地放在了瓜洲渡。
臨戰前，陸四終是接到淮安城餘淮書的求援信，信中說明軍大舉攻城，不下數萬大軍，城中已是岌岌可危，請陸四能及早率南路軍回援。
此情況，陸四未向全軍通傳，隻一心備戰。
淮軍出城時，陸四又下令揚州城的官吏士紳都隨軍至瓜州，美其名曰“觀戰”，實則是怕這些官吏士紳趁淮軍主力與明軍決戰之時在城中生亂。
此令一下，城中自又是雞飛狗跳。
明軍方麵的渡江“總指揮”並非原定的鎮江總兵張天祿，而是從南都親來鎮江督戰的史可法。
兵力方麵，明軍有操江水師一部千餘兵、鎮江總兵張天祿部四千兵，鎮海將軍鄭鴻逵部四千兵，又有內守備處標兵千餘，從江北桃源擅撤南都的撫寧侯朱國弼部數千人，計一萬五千餘明軍參與渡江之戰。
戰前，史可法已從它途徑得知史德威、李棲鳳、胡尚友三部覆沒消息，也知揚州已被賊軍下，又得鳳陽總督馬士英通報淮安賊亂，彼時自史可法以下明軍文武被淮揚糜爛局麵所驚。
南都城中，隆平侯張拱日，臨淮侯李祖述，懷寧侯孫維城，忻城伯趙之龍等勳臣更是認為渡江收複淮揚已無必要，當下應當收攏各軍沿江部署，阻止賊軍過江，為大明守住半壁江山，以侯“帝自北來”。
史可法執意收複淮揚，魏國公徐弘基也言“守江必守淮”，內守備韓讚周無主張，如此在史、徐力持下，明軍方才得以繼續渡江作戰。
隻時間又耽擱了四天。
氣得已經率部自浦口渡江至江北的劉肇基恨曰：“不聞一籌一策，用間用奇，隻戰守不定，一日數令，此戰，豈能勝！”