董卓沒花一點力氣把自己最大的後顧之憂給排除了，還有了更多的軍隊，頓時底氣足了很多。
於是在二月十五日，在強大兵力的威懾之下，遷都長安的政策得以確定。
二月十七日，皇帝劉協啟程前往長安。
三月五日，皇帝和大批官員抵達長安，前後曆時十八天。
在這次遷都行動中，還有大量中央圖書館蘭台的書籍轉移至長安，途中因為大雨的緣故，道路泥濘難行，有一半的書籍被拋棄焚燒，剩下的由司徒王允進行分門別類的整理。
董卓還命令軍隊驅使黎庶和大戶一起前往長安，不允許他們留在雒陽，不願意走的多數被殺死。
期間，董卓還命令士兵冠光明正大的劫掠不配合的士人和富戶，甚至派人盜取先帝陵墓，挖掘財寶，搞的雒陽是一地雞毛。
而在當時，董卓留在了雒陽，屯兵於畢圭苑以防禦反董聯軍，長安朝廷的內外事務都交給王允來處理。
因為王允出身並州，並不屬於關東士人集團的緣故，所以王允受到了董卓的提攜。
更因為董卓曾經做過並州刺史和並州牧，所以董卓對王允更是推心置腹，對他沒有隔閡和懷疑。
至於王允對董卓是不是也是一樣的推心置腹毫無隔閡，那還真不好說。
此一時期，王允是長安朝廷的實際控製者，董卓則在雒陽安排對抗關東聯軍的事情。
為了立威，更為了打擊關東聯軍的信心，擴軍之後兵力大盛的董卓做出了一個讓所有人都為之震撼和恐懼的決定。
殺了袁隗。
被全天下針對，董卓曾經良好的自我感覺徹底崩塌，用幻象營造出來的賢明董卓已經徹底死掉，既然他們已經決定和董卓不死不休，董卓也就幹脆徹底放飛自我了。
曾經做過的事情全部推翻，曾經的自我約束全部消失，手下眾將全部加官晉爵，並州人涼州人大力提拔任用，關東人則全力打壓，肆意淩辱殺戮。